Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMCO5AQ8N6Q1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMCO5AQ8N6Q1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMCO5AQ8N6Q1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMCO5AQ8N6Q1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TMCO5AQ8N6Q1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TMCO5AQ8N6Q1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMCO5AQ8N6Q1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMCO5AQ8N6Q1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMCO5AQ8N6Q1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TMCO5AQ8N6Q1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TMCO5AQ8N6Q1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMCO5AQ8N6Q1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMCO5AQ8N6Q1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMCO5AQ8N6Q1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMCO5AQ8N6Q1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMCO5AQ8N6Q1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMCO5AQ8N6Q1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMCO5AQ8N6Q1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMCO5AQ8N6Q1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMCO5AQ8N6Q1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMCO5AQ8N6Q1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMCO5AQ8N6Q1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMCO5AQ8N6Q1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMCO5AQ8N6Q1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMCO5AQ8N6Q1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMCO5AQ8N6Q1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMCO5AQ8N6Q1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMCO5AQ8N6Q1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TMCO5AQ8N6Q1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMCO5AQ8N6Q1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMCO5AQ8N6Q1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMCO5AQ8N6Q1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMCO5AQ8N6Q1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMCO5AQ8N6Q1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMCO5AQ8N6Q1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMCO5AQ8N6Q1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMCO5AQ8N6Q1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMCO5AQ8N6Q1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMCO5AQ8N6Q1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMCO5AQ8N6Q1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMCO5AQ8N6Q1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMCO5AQ8N6Q1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMCO5AQ8N6Q1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMCO5AQ8N6Q1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMCO5AQ8N6Q1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMCO5AQ8N6Q1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMCO5AQ8N6Q1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMCO5AQ8N6Q1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMCO5AQ8N6Q1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMCO5AQ8N6Q1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMCO5AQ8N6Q1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMCO5AQ8N6Q1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMCO5AQ8N6Q1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMCO5AQ8N6Q1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMCO5AQ8N6Q1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMCO5AQ8N6Q1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
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TMCO5AQ8N6Q1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMCO5AQ8N6Q1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMCO5AQ8N6Q1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMCO5AQ8N6Q1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMCO5AQ8N6Q1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMCO5AQ8N6Q1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMCO5AQ8N6Q1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMCO5AQ8N6Q1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMCO5AQ8N6Q1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMCO5AQ8N6Q1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMCO5AQ8N6Q1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMCO5AQ8N6Q1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMCO5AQ8N6Q1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMCO5AQ8N6Q1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMCO5AQ8N6Q1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMCO5AQ8N6Q1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMCO5AQ8N6Q1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMCO5AQ8N6Q1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
TMCO5AQ8N6Q1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TMCO5AQ8N6Q1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMCO5AQ8N6Q1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMCO5AQ8N6Q1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMCO5AQ8N6Q1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMCO5AQ8N6Q1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TMCO5AQ8N6Q1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMCO5AQ8N6Q1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMCO5AQ8N6Q1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TMCO5AQ8N6Q1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMCO5AQ8N6Q1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMCO5AQ8N6Q1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMCO5AQ8N6Q1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMCO5AQ8N6Q1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMCO5AQ8N6Q1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMCO5AQ8N6Q1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMCO5AQ8N6Q1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMCO5AQ8N6Q1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMCO5AQ8N6Q1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMCO5AQ8N6Q1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMCO5AQ8N6Q1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMCO5AQ8N6Q1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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