Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN19Q8N6F1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN19Q8N6F1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN19Q8N6F1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN19Q8N6F1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN19Q8N6F1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN19Q8N6F1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN19Q8N6F1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN19Q8N6F1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN19Q8N6F1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN19Q8N6F1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN19Q8N6F1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN19Q8N6F1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN19Q8N6F1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN19Q8N6F1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN19Q8N6F1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN19Q8N6F1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN19Q8N6F1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CLDN19Q8N6F1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN19Q8N6F1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN19Q8N6F1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN19Q8N6F1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN19Q8N6F1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN19Q8N6F1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN19Q8N6F1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN19Q8N6F1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CLDN19Q8N6F1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN19Q8N6F1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN19Q8N6F1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN19Q8N6F1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN19Q8N6F1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN19Q8N6F1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN19Q8N6F1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN19Q8N6F1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN19Q8N6F1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN19Q8N6F1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CLDN19Q8N6F1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN19Q8N6F1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN19Q8N6F1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CLDN19Q8N6F1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN19Q8N6F1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN19Q8N6F1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN19Q8N6F1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN19Q8N6F1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN19Q8N6F1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN19Q8N6F1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN19Q8N6F1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN19Q8N6F1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN19Q8N6F1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN19Q8N6F1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CLDN19Q8N6F1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN19Q8N6F1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN19Q8N6F1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN19Q8N6F1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN19Q8N6F1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN19Q8N6F1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CLDN19Q8N6F1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN19Q8N6F1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN19Q8N6F1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN19Q8N6F1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN19Q8N6F1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN19Q8N6F1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN19Q8N6F1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN19Q8N6F1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN19Q8N6F1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CLDN19Q8N6F1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN19Q8N6F1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN19Q8N6F1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN19Q8N6F1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN19Q8N6F1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CLDN19Q8N6F1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN19Q8N6F1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN19Q8N6F1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN19Q8N6F1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN19Q8N6F1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN19Q8N6F1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN19Q8N6F1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN19Q8N6F1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN19Q8N6F1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CLDN19Q8N6F1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN19Q8N6F1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN19Q8N6F1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN19Q8N6F1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN19Q8N6F1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN19Q8N6F1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN19Q8N6F1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN19Q8N6F1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN19Q8N6F1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN19Q8N6F1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN19Q8N6F1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN19Q8N6F1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN19Q8N6F1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN19Q8N6F1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CLDN19Q8N6F1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN19Q8N6F1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN19Q8N6F1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN19Q8N6F1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN19Q8N6F1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN19Q8N6F1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CLDN19Q8N6F1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
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