Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Y2

CRACR2B, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2BQ8N4Y2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CRACR2BQ8N4Y2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CRACR2BQ8N4Y2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CRACR2BQ8N4Y2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CRACR2BQ8N4Y2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CRACR2BQ8N4Y2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CRACR2BQ8N4Y2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CRACR2BQ8N4Y2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CRACR2BQ8N4Y2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CRACR2BQ8N4Y2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CRACR2BQ8N4Y2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CRACR2BQ8N4Y2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CRACR2BQ8N4Y2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CRACR2BQ8N4Y2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CRACR2BQ8N4Y2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CRACR2BQ8N4Y2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CRACR2BQ8N4Y2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CRACR2BQ8N4Y2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CRACR2BQ8N4Y2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CRACR2BQ8N4Y2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CRACR2BQ8N4Y2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CRACR2BQ8N4Y2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CRACR2BQ8N4Y2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CRACR2BQ8N4Y2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CRACR2BQ8N4Y2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CRACR2BQ8N4Y2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CRACR2BQ8N4Y2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CRACR2BQ8N4Y2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CRACR2BQ8N4Y2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CRACR2BQ8N4Y2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CRACR2BQ8N4Y2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CRACR2BQ8N4Y2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CRACR2BQ8N4Y2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CRACR2BQ8N4Y2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CRACR2BQ8N4Y2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CRACR2BQ8N4Y2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CRACR2BQ8N4Y2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CRACR2BQ8N4Y2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CRACR2BQ8N4Y2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CRACR2BQ8N4Y2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CRACR2BQ8N4Y2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CRACR2BQ8N4Y2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CRACR2BQ8N4Y2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CRACR2BQ8N4Y2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CRACR2BQ8N4Y2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CRACR2BQ8N4Y2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CRACR2BQ8N4Y2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CRACR2BQ8N4Y2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CRACR2BQ8N4Y2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CRACR2BQ8N4Y2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CRACR2BQ8N4Y2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CRACR2BQ8N4Y2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CRACR2BQ8N4Y2 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CRACR2BQ8N4Y2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CRACR2BQ8N4Y2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CRACR2BQ8N4Y2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CRACR2BQ8N4Y2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CRACR2BQ8N4Y2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CRACR2BQ8N4Y2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CRACR2BQ8N4Y2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CRACR2BQ8N4Y2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CRACR2BQ8N4Y2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CRACR2BQ8N4Y2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CRACR2BQ8N4Y2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CRACR2BQ8N4Y2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CRACR2BQ8N4Y2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CRACR2BQ8N4Y2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CRACR2BQ8N4Y2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CRACR2BQ8N4Y2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CRACR2BQ8N4Y2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CRACR2BQ8N4Y2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CRACR2BQ8N4Y2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CRACR2BQ8N4Y2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CRACR2BQ8N4Y2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CRACR2BQ8N4Y2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CRACR2BQ8N4Y2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CRACR2BQ8N4Y2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CRACR2BQ8N4Y2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CRACR2BQ8N4Y2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CRACR2BQ8N4Y2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CRACR2BQ8N4Y2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CRACR2BQ8N4Y2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CRACR2BQ8N4Y2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CRACR2BQ8N4Y2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CRACR2BQ8N4Y2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CRACR2BQ8N4Y2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CRACR2BQ8N4Y2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CRACR2BQ8N4Y2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CRACR2BQ8N4Y2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CRACR2BQ8N4Y2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CRACR2BQ8N4Y2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CRACR2BQ8N4Y2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CRACR2BQ8N4Y2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CRACR2BQ8N4Y2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CRACR2BQ8N4Y2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CRACR2BQ8N4Y2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CRACR2BQ8N4Y2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CRACR2BQ8N4Y2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CRACR2BQ8N4Y2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CRACR2BQ8N4Y2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms