Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3P4

VPS8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS8Q8N3P4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
VPS8Q8N3P4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
VPS8Q8N3P4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
VPS8Q8N3P4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
VPS8Q8N3P4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
VPS8Q8N3P4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
VPS8Q8N3P4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
VPS8Q8N3P4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
VPS8Q8N3P4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
VPS8Q8N3P4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
VPS8Q8N3P4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
VPS8Q8N3P4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
VPS8Q8N3P4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
VPS8Q8N3P4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
VPS8Q8N3P4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC36.37■■■■□ 3.41
VPS8Q8N3P4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
VPS8Q8N3P4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
VPS8Q8N3P4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
VPS8Q8N3P4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
VPS8Q8N3P4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
VPS8Q8N3P4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
VPS8Q8N3P4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
VPS8Q8N3P4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
VPS8Q8N3P4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
VPS8Q8N3P4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
VPS8Q8N3P4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
VPS8Q8N3P4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
VPS8Q8N3P4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
VPS8Q8N3P4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
VPS8Q8N3P4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
VPS8Q8N3P4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
VPS8Q8N3P4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
VPS8Q8N3P4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
VPS8Q8N3P4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
VPS8Q8N3P4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
VPS8Q8N3P4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
VPS8Q8N3P4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
VPS8Q8N3P4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
VPS8Q8N3P4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
VPS8Q8N3P4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
VPS8Q8N3P4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
VPS8Q8N3P4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
VPS8Q8N3P4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
VPS8Q8N3P4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
VPS8Q8N3P4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
VPS8Q8N3P4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
VPS8Q8N3P4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
VPS8Q8N3P4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
VPS8Q8N3P4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
VPS8Q8N3P4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
VPS8Q8N3P4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
VPS8Q8N3P4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
VPS8Q8N3P4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
VPS8Q8N3P4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
VPS8Q8N3P4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
VPS8Q8N3P4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
VPS8Q8N3P4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
VPS8Q8N3P4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
VPS8Q8N3P4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
VPS8Q8N3P4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
VPS8Q8N3P4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
VPS8Q8N3P4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
VPS8Q8N3P4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
VPS8Q8N3P4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
VPS8Q8N3P4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
VPS8Q8N3P4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
VPS8Q8N3P4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
VPS8Q8N3P4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
VPS8Q8N3P4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
VPS8Q8N3P4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
VPS8Q8N3P4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
VPS8Q8N3P4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
VPS8Q8N3P4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
VPS8Q8N3P4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
VPS8Q8N3P4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC36.24■■■■□ 3.39
VPS8Q8N3P4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
VPS8Q8N3P4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC36.24■■■■□ 3.39
VPS8Q8N3P4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
VPS8Q8N3P4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
VPS8Q8N3P4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
VPS8Q8N3P4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
VPS8Q8N3P4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
VPS8Q8N3P4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
VPS8Q8N3P4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
VPS8Q8N3P4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
VPS8Q8N3P4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
VPS8Q8N3P4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
VPS8Q8N3P4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
VPS8Q8N3P4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
VPS8Q8N3P4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
VPS8Q8N3P4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
VPS8Q8N3P4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
VPS8Q8N3P4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
VPS8Q8N3P4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
VPS8Q8N3P4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
VPS8Q8N3P4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
VPS8Q8N3P4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
VPS8Q8N3P4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
VPS8Q8N3P4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
VPS8Q8N3P4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms