Protein–RNA interactions for Protein: Q86UG4

SLCO6A1, Solute carrier organic anion transporter family member 6A1, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO6A1Q86UG4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLCO6A1Q86UG4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLCO6A1Q86UG4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLCO6A1Q86UG4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLCO6A1Q86UG4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLCO6A1Q86UG4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLCO6A1Q86UG4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLCO6A1Q86UG4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLCO6A1Q86UG4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLCO6A1Q86UG4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLCO6A1Q86UG4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLCO6A1Q86UG4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLCO6A1Q86UG4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLCO6A1Q86UG4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLCO6A1Q86UG4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLCO6A1Q86UG4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLCO6A1Q86UG4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLCO6A1Q86UG4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLCO6A1Q86UG4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLCO6A1Q86UG4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SLCO6A1Q86UG4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLCO6A1Q86UG4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLCO6A1Q86UG4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLCO6A1Q86UG4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLCO6A1Q86UG4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLCO6A1Q86UG4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLCO6A1Q86UG4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SLCO6A1Q86UG4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLCO6A1Q86UG4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLCO6A1Q86UG4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SLCO6A1Q86UG4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLCO6A1Q86UG4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLCO6A1Q86UG4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLCO6A1Q86UG4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SLCO6A1Q86UG4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLCO6A1Q86UG4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLCO6A1Q86UG4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLCO6A1Q86UG4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLCO6A1Q86UG4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SLCO6A1Q86UG4 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLCO6A1Q86UG4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLCO6A1Q86UG4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLCO6A1Q86UG4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SLCO6A1Q86UG4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLCO6A1Q86UG4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLCO6A1Q86UG4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLCO6A1Q86UG4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLCO6A1Q86UG4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLCO6A1Q86UG4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SLCO6A1Q86UG4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLCO6A1Q86UG4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLCO6A1Q86UG4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLCO6A1Q86UG4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLCO6A1Q86UG4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLCO6A1Q86UG4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLCO6A1Q86UG4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLCO6A1Q86UG4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLCO6A1Q86UG4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLCO6A1Q86UG4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLCO6A1Q86UG4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLCO6A1Q86UG4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLCO6A1Q86UG4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLCO6A1Q86UG4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLCO6A1Q86UG4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLCO6A1Q86UG4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLCO6A1Q86UG4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLCO6A1Q86UG4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLCO6A1Q86UG4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLCO6A1Q86UG4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLCO6A1Q86UG4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLCO6A1Q86UG4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLCO6A1Q86UG4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLCO6A1Q86UG4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLCO6A1Q86UG4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLCO6A1Q86UG4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLCO6A1Q86UG4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLCO6A1Q86UG4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLCO6A1Q86UG4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SLCO6A1Q86UG4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLCO6A1Q86UG4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLCO6A1Q86UG4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLCO6A1Q86UG4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLCO6A1Q86UG4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLCO6A1Q86UG4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLCO6A1Q86UG4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLCO6A1Q86UG4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLCO6A1Q86UG4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLCO6A1Q86UG4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLCO6A1Q86UG4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLCO6A1Q86UG4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLCO6A1Q86UG4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLCO6A1Q86UG4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLCO6A1Q86UG4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLCO6A1Q86UG4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLCO6A1Q86UG4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLCO6A1Q86UG4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLCO6A1Q86UG4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLCO6A1Q86UG4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLCO6A1Q86UG4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLCO6A1Q86UG4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 771.9 ms