Protein–RNA interactions for Protein: Q86UA6

RPAIN, RPA-interacting protein, humanhuman

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAINQ86UA6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPAINQ86UA6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPAINQ86UA6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPAINQ86UA6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPAINQ86UA6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPAINQ86UA6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPAINQ86UA6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RPAINQ86UA6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPAINQ86UA6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RPAINQ86UA6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
RPAINQ86UA6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPAINQ86UA6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPAINQ86UA6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPAINQ86UA6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPAINQ86UA6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPAINQ86UA6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPAINQ86UA6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
RPAINQ86UA6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPAINQ86UA6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPAINQ86UA6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPAINQ86UA6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPAINQ86UA6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPAINQ86UA6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPAINQ86UA6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPAINQ86UA6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPAINQ86UA6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPAINQ86UA6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPAINQ86UA6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPAINQ86UA6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPAINQ86UA6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPAINQ86UA6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPAINQ86UA6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPAINQ86UA6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPAINQ86UA6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RPAINQ86UA6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPAINQ86UA6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPAINQ86UA6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPAINQ86UA6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPAINQ86UA6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RPAINQ86UA6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPAINQ86UA6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPAINQ86UA6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RPAINQ86UA6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPAINQ86UA6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RPAINQ86UA6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPAINQ86UA6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPAINQ86UA6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPAINQ86UA6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPAINQ86UA6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPAINQ86UA6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RPAINQ86UA6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPAINQ86UA6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPAINQ86UA6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPAINQ86UA6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPAINQ86UA6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RPAINQ86UA6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
RPAINQ86UA6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPAINQ86UA6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPAINQ86UA6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPAINQ86UA6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPAINQ86UA6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPAINQ86UA6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPAINQ86UA6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPAINQ86UA6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPAINQ86UA6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPAINQ86UA6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPAINQ86UA6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPAINQ86UA6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPAINQ86UA6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPAINQ86UA6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPAINQ86UA6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RPAINQ86UA6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPAINQ86UA6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPAINQ86UA6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPAINQ86UA6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPAINQ86UA6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPAINQ86UA6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPAINQ86UA6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPAINQ86UA6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPAINQ86UA6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPAINQ86UA6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RPAINQ86UA6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPAINQ86UA6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPAINQ86UA6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPAINQ86UA6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPAINQ86UA6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPAINQ86UA6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPAINQ86UA6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPAINQ86UA6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPAINQ86UA6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPAINQ86UA6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPAINQ86UA6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPAINQ86UA6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPAINQ86UA6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RPAINQ86UA6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPAINQ86UA6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPAINQ86UA6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPAINQ86UA6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPAINQ86UA6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPAINQ86UA6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
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