Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3C6

ATG9A, Autophagy-related protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9AQ7Z3C6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATG9AQ7Z3C6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATG9AQ7Z3C6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATG9AQ7Z3C6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATG9AQ7Z3C6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATG9AQ7Z3C6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATG9AQ7Z3C6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ATG9AQ7Z3C6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATG9AQ7Z3C6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATG9AQ7Z3C6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATG9AQ7Z3C6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATG9AQ7Z3C6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATG9AQ7Z3C6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATG9AQ7Z3C6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ATG9AQ7Z3C6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATG9AQ7Z3C6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATG9AQ7Z3C6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATG9AQ7Z3C6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATG9AQ7Z3C6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATG9AQ7Z3C6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATG9AQ7Z3C6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATG9AQ7Z3C6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
ATG9AQ7Z3C6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
ATG9AQ7Z3C6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATG9AQ7Z3C6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATG9AQ7Z3C6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATG9AQ7Z3C6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATG9AQ7Z3C6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATG9AQ7Z3C6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATG9AQ7Z3C6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATG9AQ7Z3C6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATG9AQ7Z3C6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ATG9AQ7Z3C6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ATG9AQ7Z3C6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATG9AQ7Z3C6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATG9AQ7Z3C6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATG9AQ7Z3C6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATG9AQ7Z3C6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATG9AQ7Z3C6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ATG9AQ7Z3C6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATG9AQ7Z3C6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATG9AQ7Z3C6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATG9AQ7Z3C6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATG9AQ7Z3C6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATG9AQ7Z3C6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATG9AQ7Z3C6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATG9AQ7Z3C6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATG9AQ7Z3C6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATG9AQ7Z3C6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATG9AQ7Z3C6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATG9AQ7Z3C6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATG9AQ7Z3C6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATG9AQ7Z3C6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATG9AQ7Z3C6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATG9AQ7Z3C6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATG9AQ7Z3C6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATG9AQ7Z3C6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATG9AQ7Z3C6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATG9AQ7Z3C6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATG9AQ7Z3C6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATG9AQ7Z3C6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATG9AQ7Z3C6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATG9AQ7Z3C6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATG9AQ7Z3C6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATG9AQ7Z3C6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATG9AQ7Z3C6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ATG9AQ7Z3C6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATG9AQ7Z3C6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATG9AQ7Z3C6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATG9AQ7Z3C6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATG9AQ7Z3C6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATG9AQ7Z3C6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATG9AQ7Z3C6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATG9AQ7Z3C6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATG9AQ7Z3C6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATG9AQ7Z3C6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATG9AQ7Z3C6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATG9AQ7Z3C6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATG9AQ7Z3C6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATG9AQ7Z3C6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATG9AQ7Z3C6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATG9AQ7Z3C6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATG9AQ7Z3C6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATG9AQ7Z3C6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATG9AQ7Z3C6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATG9AQ7Z3C6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATG9AQ7Z3C6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATG9AQ7Z3C6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATG9AQ7Z3C6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATG9AQ7Z3C6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATG9AQ7Z3C6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATG9AQ7Z3C6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATG9AQ7Z3C6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATG9AQ7Z3C6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATG9AQ7Z3C6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATG9AQ7Z3C6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATG9AQ7Z3C6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATG9AQ7Z3C6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATG9AQ7Z3C6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATG9AQ7Z3C6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms