Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTQ4

CDHR3, Cadherin-related family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR3Q6ZTQ4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDHR3Q6ZTQ4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDHR3Q6ZTQ4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDHR3Q6ZTQ4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDHR3Q6ZTQ4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDHR3Q6ZTQ4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDHR3Q6ZTQ4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDHR3Q6ZTQ4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDHR3Q6ZTQ4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDHR3Q6ZTQ4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CDHR3Q6ZTQ4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDHR3Q6ZTQ4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDHR3Q6ZTQ4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDHR3Q6ZTQ4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDHR3Q6ZTQ4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDHR3Q6ZTQ4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDHR3Q6ZTQ4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDHR3Q6ZTQ4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDHR3Q6ZTQ4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDHR3Q6ZTQ4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDHR3Q6ZTQ4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDHR3Q6ZTQ4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDHR3Q6ZTQ4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDHR3Q6ZTQ4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDHR3Q6ZTQ4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDHR3Q6ZTQ4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDHR3Q6ZTQ4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDHR3Q6ZTQ4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDHR3Q6ZTQ4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDHR3Q6ZTQ4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDHR3Q6ZTQ4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDHR3Q6ZTQ4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDHR3Q6ZTQ4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDHR3Q6ZTQ4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDHR3Q6ZTQ4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDHR3Q6ZTQ4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDHR3Q6ZTQ4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDHR3Q6ZTQ4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDHR3Q6ZTQ4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDHR3Q6ZTQ4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CDHR3Q6ZTQ4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CDHR3Q6ZTQ4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CDHR3Q6ZTQ4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDHR3Q6ZTQ4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDHR3Q6ZTQ4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDHR3Q6ZTQ4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDHR3Q6ZTQ4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDHR3Q6ZTQ4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDHR3Q6ZTQ4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDHR3Q6ZTQ4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDHR3Q6ZTQ4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CDHR3Q6ZTQ4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDHR3Q6ZTQ4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDHR3Q6ZTQ4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDHR3Q6ZTQ4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDHR3Q6ZTQ4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDHR3Q6ZTQ4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDHR3Q6ZTQ4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDHR3Q6ZTQ4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDHR3Q6ZTQ4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDHR3Q6ZTQ4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDHR3Q6ZTQ4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDHR3Q6ZTQ4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDHR3Q6ZTQ4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDHR3Q6ZTQ4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDHR3Q6ZTQ4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDHR3Q6ZTQ4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDHR3Q6ZTQ4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDHR3Q6ZTQ4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDHR3Q6ZTQ4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDHR3Q6ZTQ4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDHR3Q6ZTQ4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDHR3Q6ZTQ4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
CDHR3Q6ZTQ4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDHR3Q6ZTQ4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDHR3Q6ZTQ4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDHR3Q6ZTQ4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDHR3Q6ZTQ4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDHR3Q6ZTQ4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDHR3Q6ZTQ4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDHR3Q6ZTQ4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDHR3Q6ZTQ4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CDHR3Q6ZTQ4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDHR3Q6ZTQ4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDHR3Q6ZTQ4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDHR3Q6ZTQ4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDHR3Q6ZTQ4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDHR3Q6ZTQ4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDHR3Q6ZTQ4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CDHR3Q6ZTQ4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDHR3Q6ZTQ4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDHR3Q6ZTQ4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDHR3Q6ZTQ4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDHR3Q6ZTQ4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDHR3Q6ZTQ4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDHR3Q6ZTQ4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDHR3Q6ZTQ4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDHR3Q6ZTQ4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDHR3Q6ZTQ4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDHR3Q6ZTQ4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms