Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNE9

RUFY4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY4Q6ZNE9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUFY4Q6ZNE9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUFY4Q6ZNE9 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUFY4Q6ZNE9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUFY4Q6ZNE9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUFY4Q6ZNE9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUFY4Q6ZNE9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUFY4Q6ZNE9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUFY4Q6ZNE9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUFY4Q6ZNE9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUFY4Q6ZNE9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RUFY4Q6ZNE9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RUFY4Q6ZNE9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RUFY4Q6ZNE9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RUFY4Q6ZNE9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RUFY4Q6ZNE9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RUFY4Q6ZNE9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RUFY4Q6ZNE9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RUFY4Q6ZNE9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RUFY4Q6ZNE9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RUFY4Q6ZNE9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RUFY4Q6ZNE9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
RUFY4Q6ZNE9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUFY4Q6ZNE9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUFY4Q6ZNE9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUFY4Q6ZNE9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RUFY4Q6ZNE9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RUFY4Q6ZNE9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RUFY4Q6ZNE9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RUFY4Q6ZNE9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RUFY4Q6ZNE9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RUFY4Q6ZNE9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RUFY4Q6ZNE9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RUFY4Q6ZNE9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RUFY4Q6ZNE9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RUFY4Q6ZNE9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RUFY4Q6ZNE9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RUFY4Q6ZNE9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RUFY4Q6ZNE9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RUFY4Q6ZNE9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RUFY4Q6ZNE9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RUFY4Q6ZNE9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RUFY4Q6ZNE9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RUFY4Q6ZNE9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RUFY4Q6ZNE9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RUFY4Q6ZNE9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RUFY4Q6ZNE9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RUFY4Q6ZNE9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RUFY4Q6ZNE9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RUFY4Q6ZNE9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RUFY4Q6ZNE9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RUFY4Q6ZNE9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RUFY4Q6ZNE9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RUFY4Q6ZNE9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RUFY4Q6ZNE9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RUFY4Q6ZNE9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUFY4Q6ZNE9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUFY4Q6ZNE9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUFY4Q6ZNE9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUFY4Q6ZNE9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUFY4Q6ZNE9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUFY4Q6ZNE9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUFY4Q6ZNE9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUFY4Q6ZNE9 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RUFY4Q6ZNE9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RUFY4Q6ZNE9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RUFY4Q6ZNE9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RUFY4Q6ZNE9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RUFY4Q6ZNE9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RUFY4Q6ZNE9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RUFY4Q6ZNE9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RUFY4Q6ZNE9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RUFY4Q6ZNE9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
RUFY4Q6ZNE9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RUFY4Q6ZNE9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RUFY4Q6ZNE9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RUFY4Q6ZNE9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RUFY4Q6ZNE9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RUFY4Q6ZNE9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RUFY4Q6ZNE9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RUFY4Q6ZNE9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RUFY4Q6ZNE9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RUFY4Q6ZNE9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RUFY4Q6ZNE9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RUFY4Q6ZNE9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RUFY4Q6ZNE9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RUFY4Q6ZNE9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RUFY4Q6ZNE9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RUFY4Q6ZNE9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RUFY4Q6ZNE9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RUFY4Q6ZNE9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RUFY4Q6ZNE9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RUFY4Q6ZNE9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RUFY4Q6ZNE9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RUFY4Q6ZNE9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RUFY4Q6ZNE9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RUFY4Q6ZNE9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RUFY4Q6ZNE9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RUFY4Q6ZNE9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RUFY4Q6ZNE9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms