Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPOCD1Q6ZMY3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPOCD1Q6ZMY3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPOCD1Q6ZMY3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPOCD1Q6ZMY3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPOCD1Q6ZMY3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPOCD1Q6ZMY3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPOCD1Q6ZMY3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SPOCD1Q6ZMY3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPOCD1Q6ZMY3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPOCD1Q6ZMY3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPOCD1Q6ZMY3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPOCD1Q6ZMY3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPOCD1Q6ZMY3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPOCD1Q6ZMY3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPOCD1Q6ZMY3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPOCD1Q6ZMY3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPOCD1Q6ZMY3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPOCD1Q6ZMY3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPOCD1Q6ZMY3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPOCD1Q6ZMY3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPOCD1Q6ZMY3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPOCD1Q6ZMY3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPOCD1Q6ZMY3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPOCD1Q6ZMY3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SPOCD1Q6ZMY3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPOCD1Q6ZMY3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPOCD1Q6ZMY3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPOCD1Q6ZMY3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPOCD1Q6ZMY3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPOCD1Q6ZMY3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPOCD1Q6ZMY3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPOCD1Q6ZMY3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPOCD1Q6ZMY3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPOCD1Q6ZMY3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPOCD1Q6ZMY3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPOCD1Q6ZMY3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPOCD1Q6ZMY3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPOCD1Q6ZMY3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPOCD1Q6ZMY3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPOCD1Q6ZMY3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPOCD1Q6ZMY3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPOCD1Q6ZMY3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPOCD1Q6ZMY3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SPOCD1Q6ZMY3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPOCD1Q6ZMY3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPOCD1Q6ZMY3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPOCD1Q6ZMY3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPOCD1Q6ZMY3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPOCD1Q6ZMY3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPOCD1Q6ZMY3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SPOCD1Q6ZMY3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPOCD1Q6ZMY3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPOCD1Q6ZMY3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPOCD1Q6ZMY3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPOCD1Q6ZMY3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPOCD1Q6ZMY3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPOCD1Q6ZMY3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPOCD1Q6ZMY3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPOCD1Q6ZMY3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPOCD1Q6ZMY3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SPOCD1Q6ZMY3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPOCD1Q6ZMY3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPOCD1Q6ZMY3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPOCD1Q6ZMY3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPOCD1Q6ZMY3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SPOCD1Q6ZMY3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPOCD1Q6ZMY3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPOCD1Q6ZMY3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPOCD1Q6ZMY3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPOCD1Q6ZMY3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPOCD1Q6ZMY3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SPOCD1Q6ZMY3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPOCD1Q6ZMY3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPOCD1Q6ZMY3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPOCD1Q6ZMY3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPOCD1Q6ZMY3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPOCD1Q6ZMY3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPOCD1Q6ZMY3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPOCD1Q6ZMY3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPOCD1Q6ZMY3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPOCD1Q6ZMY3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SPOCD1Q6ZMY3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPOCD1Q6ZMY3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPOCD1Q6ZMY3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPOCD1Q6ZMY3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPOCD1Q6ZMY3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPOCD1Q6ZMY3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPOCD1Q6ZMY3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SPOCD1Q6ZMY3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPOCD1Q6ZMY3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPOCD1Q6ZMY3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SPOCD1Q6ZMY3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPOCD1Q6ZMY3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms