Protein–RNA interactions for Protein: Q6WBX8

RAD9B, Cell cycle checkpoint control protein RAD9B, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9BQ6WBX8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD9BQ6WBX8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD9BQ6WBX8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD9BQ6WBX8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD9BQ6WBX8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD9BQ6WBX8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD9BQ6WBX8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD9BQ6WBX8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD9BQ6WBX8 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD9BQ6WBX8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD9BQ6WBX8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD9BQ6WBX8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD9BQ6WBX8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD9BQ6WBX8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD9BQ6WBX8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD9BQ6WBX8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD9BQ6WBX8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD9BQ6WBX8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD9BQ6WBX8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD9BQ6WBX8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD9BQ6WBX8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD9BQ6WBX8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD9BQ6WBX8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD9BQ6WBX8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD9BQ6WBX8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD9BQ6WBX8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD9BQ6WBX8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD9BQ6WBX8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD9BQ6WBX8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD9BQ6WBX8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD9BQ6WBX8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD9BQ6WBX8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD9BQ6WBX8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD9BQ6WBX8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD9BQ6WBX8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD9BQ6WBX8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD9BQ6WBX8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD9BQ6WBX8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAD9BQ6WBX8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RAD9BQ6WBX8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAD9BQ6WBX8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAD9BQ6WBX8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAD9BQ6WBX8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAD9BQ6WBX8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAD9BQ6WBX8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAD9BQ6WBX8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAD9BQ6WBX8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAD9BQ6WBX8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAD9BQ6WBX8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAD9BQ6WBX8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAD9BQ6WBX8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAD9BQ6WBX8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RAD9BQ6WBX8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RAD9BQ6WBX8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAD9BQ6WBX8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAD9BQ6WBX8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAD9BQ6WBX8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAD9BQ6WBX8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAD9BQ6WBX8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAD9BQ6WBX8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAD9BQ6WBX8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAD9BQ6WBX8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAD9BQ6WBX8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAD9BQ6WBX8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAD9BQ6WBX8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAD9BQ6WBX8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAD9BQ6WBX8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAD9BQ6WBX8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAD9BQ6WBX8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAD9BQ6WBX8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAD9BQ6WBX8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAD9BQ6WBX8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAD9BQ6WBX8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAD9BQ6WBX8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RAD9BQ6WBX8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAD9BQ6WBX8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAD9BQ6WBX8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAD9BQ6WBX8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAD9BQ6WBX8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAD9BQ6WBX8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RAD9BQ6WBX8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAD9BQ6WBX8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAD9BQ6WBX8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAD9BQ6WBX8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAD9BQ6WBX8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAD9BQ6WBX8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAD9BQ6WBX8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAD9BQ6WBX8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAD9BQ6WBX8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAD9BQ6WBX8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAD9BQ6WBX8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAD9BQ6WBX8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAD9BQ6WBX8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAD9BQ6WBX8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RAD9BQ6WBX8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RAD9BQ6WBX8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAD9BQ6WBX8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAD9BQ6WBX8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAD9BQ6WBX8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAD9BQ6WBX8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms