Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXX9

RSPO2, R-spondin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO2Q6UXX9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RSPO2Q6UXX9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RSPO2Q6UXX9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RSPO2Q6UXX9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RSPO2Q6UXX9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RSPO2Q6UXX9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RSPO2Q6UXX9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RSPO2Q6UXX9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RSPO2Q6UXX9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RSPO2Q6UXX9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RSPO2Q6UXX9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RSPO2Q6UXX9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RSPO2Q6UXX9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RSPO2Q6UXX9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RSPO2Q6UXX9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RSPO2Q6UXX9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RSPO2Q6UXX9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RSPO2Q6UXX9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RSPO2Q6UXX9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RSPO2Q6UXX9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RSPO2Q6UXX9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RSPO2Q6UXX9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RSPO2Q6UXX9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RSPO2Q6UXX9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RSPO2Q6UXX9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RSPO2Q6UXX9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RSPO2Q6UXX9 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RSPO2Q6UXX9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RSPO2Q6UXX9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RSPO2Q6UXX9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RSPO2Q6UXX9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RSPO2Q6UXX9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RSPO2Q6UXX9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RSPO2Q6UXX9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RSPO2Q6UXX9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RSPO2Q6UXX9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RSPO2Q6UXX9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RSPO2Q6UXX9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RSPO2Q6UXX9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RSPO2Q6UXX9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RSPO2Q6UXX9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RSPO2Q6UXX9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RSPO2Q6UXX9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RSPO2Q6UXX9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RSPO2Q6UXX9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RSPO2Q6UXX9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RSPO2Q6UXX9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RSPO2Q6UXX9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RSPO2Q6UXX9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RSPO2Q6UXX9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RSPO2Q6UXX9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RSPO2Q6UXX9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RSPO2Q6UXX9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RSPO2Q6UXX9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RSPO2Q6UXX9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RSPO2Q6UXX9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RSPO2Q6UXX9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RSPO2Q6UXX9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RSPO2Q6UXX9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RSPO2Q6UXX9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RSPO2Q6UXX9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RSPO2Q6UXX9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RSPO2Q6UXX9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RSPO2Q6UXX9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RSPO2Q6UXX9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RSPO2Q6UXX9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RSPO2Q6UXX9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RSPO2Q6UXX9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RSPO2Q6UXX9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RSPO2Q6UXX9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RSPO2Q6UXX9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RSPO2Q6UXX9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RSPO2Q6UXX9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RSPO2Q6UXX9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RSPO2Q6UXX9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RSPO2Q6UXX9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RSPO2Q6UXX9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RSPO2Q6UXX9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RSPO2Q6UXX9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RSPO2Q6UXX9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RSPO2Q6UXX9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RSPO2Q6UXX9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RSPO2Q6UXX9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RSPO2Q6UXX9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RSPO2Q6UXX9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RSPO2Q6UXX9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RSPO2Q6UXX9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RSPO2Q6UXX9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RSPO2Q6UXX9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RSPO2Q6UXX9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RSPO2Q6UXX9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RSPO2Q6UXX9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RSPO2Q6UXX9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RSPO2Q6UXX9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RSPO2Q6UXX9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RSPO2Q6UXX9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RSPO2Q6UXX9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RSPO2Q6UXX9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RSPO2Q6UXX9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RSPO2Q6UXX9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms