Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRIG3Q6UXM1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRIG3Q6UXM1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRIG3Q6UXM1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRIG3Q6UXM1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRIG3Q6UXM1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LRIG3Q6UXM1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LRIG3Q6UXM1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LRIG3Q6UXM1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRIG3Q6UXM1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRIG3Q6UXM1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRIG3Q6UXM1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRIG3Q6UXM1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRIG3Q6UXM1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRIG3Q6UXM1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRIG3Q6UXM1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRIG3Q6UXM1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRIG3Q6UXM1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRIG3Q6UXM1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRIG3Q6UXM1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRIG3Q6UXM1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRIG3Q6UXM1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRIG3Q6UXM1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRIG3Q6UXM1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRIG3Q6UXM1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRIG3Q6UXM1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRIG3Q6UXM1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRIG3Q6UXM1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRIG3Q6UXM1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRIG3Q6UXM1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRIG3Q6UXM1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRIG3Q6UXM1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRIG3Q6UXM1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRIG3Q6UXM1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRIG3Q6UXM1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRIG3Q6UXM1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRIG3Q6UXM1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRIG3Q6UXM1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRIG3Q6UXM1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRIG3Q6UXM1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRIG3Q6UXM1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRIG3Q6UXM1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRIG3Q6UXM1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRIG3Q6UXM1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRIG3Q6UXM1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LRIG3Q6UXM1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRIG3Q6UXM1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRIG3Q6UXM1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRIG3Q6UXM1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRIG3Q6UXM1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRIG3Q6UXM1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRIG3Q6UXM1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRIG3Q6UXM1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRIG3Q6UXM1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRIG3Q6UXM1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRIG3Q6UXM1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRIG3Q6UXM1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRIG3Q6UXM1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRIG3Q6UXM1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRIG3Q6UXM1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRIG3Q6UXM1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRIG3Q6UXM1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRIG3Q6UXM1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRIG3Q6UXM1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRIG3Q6UXM1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRIG3Q6UXM1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRIG3Q6UXM1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRIG3Q6UXM1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRIG3Q6UXM1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRIG3Q6UXM1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRIG3Q6UXM1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LRIG3Q6UXM1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRIG3Q6UXM1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LRIG3Q6UXM1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRIG3Q6UXM1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRIG3Q6UXM1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRIG3Q6UXM1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRIG3Q6UXM1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRIG3Q6UXM1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LRIG3Q6UXM1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRIG3Q6UXM1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRIG3Q6UXM1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRIG3Q6UXM1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRIG3Q6UXM1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRIG3Q6UXM1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRIG3Q6UXM1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRIG3Q6UXM1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRIG3Q6UXM1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRIG3Q6UXM1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRIG3Q6UXM1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRIG3Q6UXM1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRIG3Q6UXM1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRIG3Q6UXM1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRIG3Q6UXM1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRIG3Q6UXM1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRIG3Q6UXM1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRIG3Q6UXM1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRIG3Q6UXM1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRIG3Q6UXM1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRIG3Q6UXM1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms