Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWP7

LCLAT1, Lysocardiolipin acyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCLAT1Q6UWP7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LCLAT1Q6UWP7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LCLAT1Q6UWP7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LCLAT1Q6UWP7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LCLAT1Q6UWP7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LCLAT1Q6UWP7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LCLAT1Q6UWP7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LCLAT1Q6UWP7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LCLAT1Q6UWP7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LCLAT1Q6UWP7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LCLAT1Q6UWP7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LCLAT1Q6UWP7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LCLAT1Q6UWP7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LCLAT1Q6UWP7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LCLAT1Q6UWP7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LCLAT1Q6UWP7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LCLAT1Q6UWP7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LCLAT1Q6UWP7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LCLAT1Q6UWP7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LCLAT1Q6UWP7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LCLAT1Q6UWP7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LCLAT1Q6UWP7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LCLAT1Q6UWP7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LCLAT1Q6UWP7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LCLAT1Q6UWP7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LCLAT1Q6UWP7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LCLAT1Q6UWP7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LCLAT1Q6UWP7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LCLAT1Q6UWP7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LCLAT1Q6UWP7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LCLAT1Q6UWP7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LCLAT1Q6UWP7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LCLAT1Q6UWP7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LCLAT1Q6UWP7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LCLAT1Q6UWP7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LCLAT1Q6UWP7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LCLAT1Q6UWP7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LCLAT1Q6UWP7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LCLAT1Q6UWP7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LCLAT1Q6UWP7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LCLAT1Q6UWP7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LCLAT1Q6UWP7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LCLAT1Q6UWP7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LCLAT1Q6UWP7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LCLAT1Q6UWP7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LCLAT1Q6UWP7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LCLAT1Q6UWP7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LCLAT1Q6UWP7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LCLAT1Q6UWP7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LCLAT1Q6UWP7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LCLAT1Q6UWP7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LCLAT1Q6UWP7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LCLAT1Q6UWP7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LCLAT1Q6UWP7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LCLAT1Q6UWP7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LCLAT1Q6UWP7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LCLAT1Q6UWP7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LCLAT1Q6UWP7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LCLAT1Q6UWP7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LCLAT1Q6UWP7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LCLAT1Q6UWP7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LCLAT1Q6UWP7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LCLAT1Q6UWP7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LCLAT1Q6UWP7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LCLAT1Q6UWP7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LCLAT1Q6UWP7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LCLAT1Q6UWP7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LCLAT1Q6UWP7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LCLAT1Q6UWP7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LCLAT1Q6UWP7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LCLAT1Q6UWP7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LCLAT1Q6UWP7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LCLAT1Q6UWP7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LCLAT1Q6UWP7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LCLAT1Q6UWP7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LCLAT1Q6UWP7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LCLAT1Q6UWP7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LCLAT1Q6UWP7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LCLAT1Q6UWP7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LCLAT1Q6UWP7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LCLAT1Q6UWP7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LCLAT1Q6UWP7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LCLAT1Q6UWP7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LCLAT1Q6UWP7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LCLAT1Q6UWP7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LCLAT1Q6UWP7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LCLAT1Q6UWP7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LCLAT1Q6UWP7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LCLAT1Q6UWP7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LCLAT1Q6UWP7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LCLAT1Q6UWP7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LCLAT1Q6UWP7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LCLAT1Q6UWP7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LCLAT1Q6UWP7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LCLAT1Q6UWP7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LCLAT1Q6UWP7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LCLAT1Q6UWP7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LCLAT1Q6UWP7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LCLAT1Q6UWP7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LCLAT1Q6UWP7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms