Protein–RNA interactions for Protein: Q6SZW1

SARM1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARM1Q6SZW1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SARM1Q6SZW1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SARM1Q6SZW1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SARM1Q6SZW1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SARM1Q6SZW1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SARM1Q6SZW1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SARM1Q6SZW1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SARM1Q6SZW1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SARM1Q6SZW1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SARM1Q6SZW1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SARM1Q6SZW1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SARM1Q6SZW1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SARM1Q6SZW1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SARM1Q6SZW1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SARM1Q6SZW1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SARM1Q6SZW1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SARM1Q6SZW1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SARM1Q6SZW1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SARM1Q6SZW1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SARM1Q6SZW1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SARM1Q6SZW1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SARM1Q6SZW1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SARM1Q6SZW1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SARM1Q6SZW1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SARM1Q6SZW1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SARM1Q6SZW1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SARM1Q6SZW1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SARM1Q6SZW1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SARM1Q6SZW1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SARM1Q6SZW1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SARM1Q6SZW1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SARM1Q6SZW1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SARM1Q6SZW1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SARM1Q6SZW1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SARM1Q6SZW1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SARM1Q6SZW1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SARM1Q6SZW1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SARM1Q6SZW1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SARM1Q6SZW1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SARM1Q6SZW1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SARM1Q6SZW1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SARM1Q6SZW1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SARM1Q6SZW1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SARM1Q6SZW1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SARM1Q6SZW1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SARM1Q6SZW1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SARM1Q6SZW1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SARM1Q6SZW1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SARM1Q6SZW1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SARM1Q6SZW1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SARM1Q6SZW1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SARM1Q6SZW1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SARM1Q6SZW1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SARM1Q6SZW1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SARM1Q6SZW1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SARM1Q6SZW1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SARM1Q6SZW1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SARM1Q6SZW1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SARM1Q6SZW1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SARM1Q6SZW1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SARM1Q6SZW1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SARM1Q6SZW1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SARM1Q6SZW1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SARM1Q6SZW1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SARM1Q6SZW1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SARM1Q6SZW1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SARM1Q6SZW1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SARM1Q6SZW1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SARM1Q6SZW1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SARM1Q6SZW1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SARM1Q6SZW1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SARM1Q6SZW1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SARM1Q6SZW1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SARM1Q6SZW1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SARM1Q6SZW1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SARM1Q6SZW1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SARM1Q6SZW1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SARM1Q6SZW1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SARM1Q6SZW1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SARM1Q6SZW1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SARM1Q6SZW1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SARM1Q6SZW1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SARM1Q6SZW1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SARM1Q6SZW1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SARM1Q6SZW1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SARM1Q6SZW1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SARM1Q6SZW1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SARM1Q6SZW1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SARM1Q6SZW1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SARM1Q6SZW1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SARM1Q6SZW1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SARM1Q6SZW1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SARM1Q6SZW1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SARM1Q6SZW1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SARM1Q6SZW1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SARM1Q6SZW1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SARM1Q6SZW1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SARM1Q6SZW1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SARM1Q6SZW1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SARM1Q6SZW1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms