Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC174Q6PII3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC174Q6PII3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC174Q6PII3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC174Q6PII3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC174Q6PII3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC174Q6PII3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC174Q6PII3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC174Q6PII3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC174Q6PII3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CCDC174Q6PII3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CCDC174Q6PII3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC174Q6PII3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC174Q6PII3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC174Q6PII3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC174Q6PII3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC174Q6PII3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC174Q6PII3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC174Q6PII3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC174Q6PII3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC174Q6PII3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC174Q6PII3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC174Q6PII3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC174Q6PII3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC174Q6PII3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC174Q6PII3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC174Q6PII3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC174Q6PII3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC174Q6PII3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC174Q6PII3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC174Q6PII3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC174Q6PII3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC174Q6PII3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC174Q6PII3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC174Q6PII3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC174Q6PII3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC174Q6PII3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC174Q6PII3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC174Q6PII3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC174Q6PII3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC174Q6PII3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC174Q6PII3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC174Q6PII3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC174Q6PII3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC174Q6PII3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC174Q6PII3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC174Q6PII3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC174Q6PII3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC174Q6PII3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC174Q6PII3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC174Q6PII3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC174Q6PII3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC174Q6PII3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC174Q6PII3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC174Q6PII3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC174Q6PII3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC174Q6PII3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC174Q6PII3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC174Q6PII3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC174Q6PII3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
CCDC174Q6PII3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC174Q6PII3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC174Q6PII3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC174Q6PII3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC174Q6PII3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC174Q6PII3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC174Q6PII3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC174Q6PII3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC174Q6PII3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC174Q6PII3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC174Q6PII3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC174Q6PII3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC174Q6PII3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC174Q6PII3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC174Q6PII3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC174Q6PII3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC174Q6PII3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC174Q6PII3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC174Q6PII3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC174Q6PII3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC174Q6PII3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC174Q6PII3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC174Q6PII3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC174Q6PII3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC174Q6PII3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC174Q6PII3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC174Q6PII3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC174Q6PII3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC174Q6PII3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC174Q6PII3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC174Q6PII3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC174Q6PII3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC174Q6PII3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC174Q6PII3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC174Q6PII3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC174Q6PII3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC174Q6PII3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC174Q6PII3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC174Q6PII3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC174Q6PII3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms