Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZCCHC12Q6PEW1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZCCHC12Q6PEW1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZCCHC12Q6PEW1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZCCHC12Q6PEW1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZCCHC12Q6PEW1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZCCHC12Q6PEW1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZCCHC12Q6PEW1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZCCHC12Q6PEW1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZCCHC12Q6PEW1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZCCHC12Q6PEW1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZCCHC12Q6PEW1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZCCHC12Q6PEW1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZCCHC12Q6PEW1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZCCHC12Q6PEW1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZCCHC12Q6PEW1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZCCHC12Q6PEW1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZCCHC12Q6PEW1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZCCHC12Q6PEW1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZCCHC12Q6PEW1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZCCHC12Q6PEW1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZCCHC12Q6PEW1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZCCHC12Q6PEW1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZCCHC12Q6PEW1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZCCHC12Q6PEW1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ZCCHC12Q6PEW1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZCCHC12Q6PEW1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZCCHC12Q6PEW1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZCCHC12Q6PEW1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZCCHC12Q6PEW1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ZCCHC12Q6PEW1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZCCHC12Q6PEW1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZCCHC12Q6PEW1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZCCHC12Q6PEW1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZCCHC12Q6PEW1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZCCHC12Q6PEW1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZCCHC12Q6PEW1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZCCHC12Q6PEW1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZCCHC12Q6PEW1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZCCHC12Q6PEW1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZCCHC12Q6PEW1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZCCHC12Q6PEW1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZCCHC12Q6PEW1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZCCHC12Q6PEW1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZCCHC12Q6PEW1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZCCHC12Q6PEW1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZCCHC12Q6PEW1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZCCHC12Q6PEW1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZCCHC12Q6PEW1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZCCHC12Q6PEW1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZCCHC12Q6PEW1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZCCHC12Q6PEW1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZCCHC12Q6PEW1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZCCHC12Q6PEW1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZCCHC12Q6PEW1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZCCHC12Q6PEW1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZCCHC12Q6PEW1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZCCHC12Q6PEW1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZCCHC12Q6PEW1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZCCHC12Q6PEW1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZCCHC12Q6PEW1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZCCHC12Q6PEW1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZCCHC12Q6PEW1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ZCCHC12Q6PEW1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZCCHC12Q6PEW1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZCCHC12Q6PEW1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZCCHC12Q6PEW1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZCCHC12Q6PEW1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZCCHC12Q6PEW1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZCCHC12Q6PEW1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZCCHC12Q6PEW1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ZCCHC12Q6PEW1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZCCHC12Q6PEW1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZCCHC12Q6PEW1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ZCCHC12Q6PEW1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZCCHC12Q6PEW1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZCCHC12Q6PEW1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZCCHC12Q6PEW1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZCCHC12Q6PEW1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ZCCHC12Q6PEW1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZCCHC12Q6PEW1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZCCHC12Q6PEW1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZCCHC12Q6PEW1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZCCHC12Q6PEW1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZCCHC12Q6PEW1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZCCHC12Q6PEW1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZCCHC12Q6PEW1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZCCHC12Q6PEW1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZCCHC12Q6PEW1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ZCCHC12Q6PEW1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZCCHC12Q6PEW1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZCCHC12Q6PEW1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZCCHC12Q6PEW1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZCCHC12Q6PEW1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZCCHC12Q6PEW1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZCCHC12Q6PEW1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms