Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAVIN1Q6NZI2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAVIN1Q6NZI2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAVIN1Q6NZI2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAVIN1Q6NZI2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAVIN1Q6NZI2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAVIN1Q6NZI2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAVIN1Q6NZI2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAVIN1Q6NZI2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAVIN1Q6NZI2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAVIN1Q6NZI2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAVIN1Q6NZI2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAVIN1Q6NZI2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAVIN1Q6NZI2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CAVIN1Q6NZI2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAVIN1Q6NZI2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAVIN1Q6NZI2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAVIN1Q6NZI2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAVIN1Q6NZI2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAVIN1Q6NZI2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAVIN1Q6NZI2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CAVIN1Q6NZI2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAVIN1Q6NZI2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAVIN1Q6NZI2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAVIN1Q6NZI2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CAVIN1Q6NZI2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CAVIN1Q6NZI2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CAVIN1Q6NZI2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CAVIN1Q6NZI2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CAVIN1Q6NZI2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CAVIN1Q6NZI2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CAVIN1Q6NZI2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CAVIN1Q6NZI2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CAVIN1Q6NZI2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CAVIN1Q6NZI2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CAVIN1Q6NZI2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CAVIN1Q6NZI2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CAVIN1Q6NZI2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CAVIN1Q6NZI2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CAVIN1Q6NZI2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAVIN1Q6NZI2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAVIN1Q6NZI2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAVIN1Q6NZI2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAVIN1Q6NZI2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAVIN1Q6NZI2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAVIN1Q6NZI2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAVIN1Q6NZI2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CAVIN1Q6NZI2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CAVIN1Q6NZI2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CAVIN1Q6NZI2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CAVIN1Q6NZI2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CAVIN1Q6NZI2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CAVIN1Q6NZI2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CAVIN1Q6NZI2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CAVIN1Q6NZI2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CAVIN1Q6NZI2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CAVIN1Q6NZI2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CAVIN1Q6NZI2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CAVIN1Q6NZI2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CAVIN1Q6NZI2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CAVIN1Q6NZI2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CAVIN1Q6NZI2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CAVIN1Q6NZI2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CAVIN1Q6NZI2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CAVIN1Q6NZI2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CAVIN1Q6NZI2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CAVIN1Q6NZI2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CAVIN1Q6NZI2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CAVIN1Q6NZI2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CAVIN1Q6NZI2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CAVIN1Q6NZI2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CAVIN1Q6NZI2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CAVIN1Q6NZI2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CAVIN1Q6NZI2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CAVIN1Q6NZI2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CAVIN1Q6NZI2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CAVIN1Q6NZI2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CAVIN1Q6NZI2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CAVIN1Q6NZI2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CAVIN1Q6NZI2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CAVIN1Q6NZI2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CAVIN1Q6NZI2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CAVIN1Q6NZI2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CAVIN1Q6NZI2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CAVIN1Q6NZI2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CAVIN1Q6NZI2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CAVIN1Q6NZI2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CAVIN1Q6NZI2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CAVIN1Q6NZI2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CAVIN1Q6NZI2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CAVIN1Q6NZI2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CAVIN1Q6NZI2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CAVIN1Q6NZI2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CAVIN1Q6NZI2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CAVIN1Q6NZI2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CAVIN1Q6NZI2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CAVIN1Q6NZI2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CAVIN1Q6NZI2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CAVIN1Q6NZI2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CAVIN1Q6NZI2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.7 ms