Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H3F3CQ6NXT2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
H3F3CQ6NXT2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
H3F3CQ6NXT2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H3F3CQ6NXT2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H3F3CQ6NXT2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H3F3CQ6NXT2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H3F3CQ6NXT2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H3F3CQ6NXT2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H3F3CQ6NXT2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
H3F3CQ6NXT2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
H3F3CQ6NXT2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H3F3CQ6NXT2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H3F3CQ6NXT2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H3F3CQ6NXT2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H3F3CQ6NXT2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
H3F3CQ6NXT2 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H3F3CQ6NXT2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H3F3CQ6NXT2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H3F3CQ6NXT2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H3F3CQ6NXT2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H3F3CQ6NXT2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H3F3CQ6NXT2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
H3F3CQ6NXT2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
H3F3CQ6NXT2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
H3F3CQ6NXT2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H3F3CQ6NXT2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H3F3CQ6NXT2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H3F3CQ6NXT2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
H3F3CQ6NXT2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
H3F3CQ6NXT2 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
H3F3CQ6NXT2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
H3F3CQ6NXT2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H3F3CQ6NXT2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H3F3CQ6NXT2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H3F3CQ6NXT2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H3F3CQ6NXT2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H3F3CQ6NXT2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
H3F3CQ6NXT2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H3F3CQ6NXT2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
H3F3CQ6NXT2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H3F3CQ6NXT2 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
H3F3CQ6NXT2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
H3F3CQ6NXT2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H3F3CQ6NXT2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H3F3CQ6NXT2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H3F3CQ6NXT2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H3F3CQ6NXT2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
H3F3CQ6NXT2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H3F3CQ6NXT2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H3F3CQ6NXT2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H3F3CQ6NXT2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
H3F3CQ6NXT2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
H3F3CQ6NXT2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H3F3CQ6NXT2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H3F3CQ6NXT2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
H3F3CQ6NXT2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H3F3CQ6NXT2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
H3F3CQ6NXT2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
H3F3CQ6NXT2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
H3F3CQ6NXT2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H3F3CQ6NXT2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
H3F3CQ6NXT2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
H3F3CQ6NXT2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
H3F3CQ6NXT2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
H3F3CQ6NXT2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
H3F3CQ6NXT2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
H3F3CQ6NXT2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
H3F3CQ6NXT2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
H3F3CQ6NXT2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H3F3CQ6NXT2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
H3F3CQ6NXT2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
H3F3CQ6NXT2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
H3F3CQ6NXT2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H3F3CQ6NXT2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H3F3CQ6NXT2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H3F3CQ6NXT2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H3F3CQ6NXT2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
H3F3CQ6NXT2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H3F3CQ6NXT2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
H3F3CQ6NXT2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H3F3CQ6NXT2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H3F3CQ6NXT2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
H3F3CQ6NXT2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
H3F3CQ6NXT2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
H3F3CQ6NXT2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H3F3CQ6NXT2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H3F3CQ6NXT2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H3F3CQ6NXT2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
H3F3CQ6NXT2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
H3F3CQ6NXT2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H3F3CQ6NXT2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
H3F3CQ6NXT2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
H3F3CQ6NXT2 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
H3F3CQ6NXT2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
H3F3CQ6NXT2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H3F3CQ6NXT2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
H3F3CQ6NXT2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
H3F3CQ6NXT2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
H3F3CQ6NXT2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.9 ms