Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW34

NEPRO, Nucleolus and neural progenitor protein, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEPROQ6NW34 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEPROQ6NW34 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEPROQ6NW34 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEPROQ6NW34 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEPROQ6NW34 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEPROQ6NW34 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NEPROQ6NW34 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEPROQ6NW34 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEPROQ6NW34 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEPROQ6NW34 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEPROQ6NW34 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NEPROQ6NW34 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEPROQ6NW34 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEPROQ6NW34 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEPROQ6NW34 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEPROQ6NW34 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEPROQ6NW34 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NEPROQ6NW34 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEPROQ6NW34 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEPROQ6NW34 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NEPROQ6NW34 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NEPROQ6NW34 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEPROQ6NW34 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEPROQ6NW34 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEPROQ6NW34 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEPROQ6NW34 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEPROQ6NW34 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEPROQ6NW34 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEPROQ6NW34 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEPROQ6NW34 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEPROQ6NW34 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NEPROQ6NW34 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEPROQ6NW34 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEPROQ6NW34 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEPROQ6NW34 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEPROQ6NW34 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEPROQ6NW34 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEPROQ6NW34 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEPROQ6NW34 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEPROQ6NW34 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NEPROQ6NW34 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEPROQ6NW34 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEPROQ6NW34 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEPROQ6NW34 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NEPROQ6NW34 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEPROQ6NW34 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEPROQ6NW34 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEPROQ6NW34 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEPROQ6NW34 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEPROQ6NW34 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEPROQ6NW34 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEPROQ6NW34 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEPROQ6NW34 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEPROQ6NW34 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NEPROQ6NW34 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEPROQ6NW34 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEPROQ6NW34 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEPROQ6NW34 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEPROQ6NW34 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEPROQ6NW34 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEPROQ6NW34 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEPROQ6NW34 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEPROQ6NW34 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEPROQ6NW34 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NEPROQ6NW34 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEPROQ6NW34 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEPROQ6NW34 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEPROQ6NW34 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NEPROQ6NW34 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NEPROQ6NW34 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEPROQ6NW34 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEPROQ6NW34 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEPROQ6NW34 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEPROQ6NW34 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEPROQ6NW34 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEPROQ6NW34 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NEPROQ6NW34 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NEPROQ6NW34 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEPROQ6NW34 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEPROQ6NW34 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEPROQ6NW34 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEPROQ6NW34 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEPROQ6NW34 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEPROQ6NW34 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEPROQ6NW34 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEPROQ6NW34 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEPROQ6NW34 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEPROQ6NW34 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NEPROQ6NW34 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEPROQ6NW34 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEPROQ6NW34 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEPROQ6NW34 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEPROQ6NW34 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEPROQ6NW34 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEPROQ6NW34 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NEPROQ6NW34 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEPROQ6NW34 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEPROQ6NW34 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEPROQ6NW34 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NEPROQ6NW34 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms