Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RWDD4Q6NW29 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RWDD4Q6NW29 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RWDD4Q6NW29 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RWDD4Q6NW29 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RWDD4Q6NW29 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RWDD4Q6NW29 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RWDD4Q6NW29 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RWDD4Q6NW29 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RWDD4Q6NW29 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RWDD4Q6NW29 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RWDD4Q6NW29 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RWDD4Q6NW29 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RWDD4Q6NW29 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RWDD4Q6NW29 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RWDD4Q6NW29 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RWDD4Q6NW29 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RWDD4Q6NW29 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RWDD4Q6NW29 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RWDD4Q6NW29 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RWDD4Q6NW29 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RWDD4Q6NW29 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RWDD4Q6NW29 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RWDD4Q6NW29 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RWDD4Q6NW29 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RWDD4Q6NW29 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RWDD4Q6NW29 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RWDD4Q6NW29 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RWDD4Q6NW29 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RWDD4Q6NW29 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RWDD4Q6NW29 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RWDD4Q6NW29 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RWDD4Q6NW29 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RWDD4Q6NW29 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RWDD4Q6NW29 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RWDD4Q6NW29 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RWDD4Q6NW29 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RWDD4Q6NW29 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RWDD4Q6NW29 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RWDD4Q6NW29 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RWDD4Q6NW29 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RWDD4Q6NW29 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RWDD4Q6NW29 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RWDD4Q6NW29 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RWDD4Q6NW29 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RWDD4Q6NW29 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RWDD4Q6NW29 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RWDD4Q6NW29 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RWDD4Q6NW29 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RWDD4Q6NW29 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RWDD4Q6NW29 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RWDD4Q6NW29 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RWDD4Q6NW29 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RWDD4Q6NW29 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RWDD4Q6NW29 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RWDD4Q6NW29 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RWDD4Q6NW29 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RWDD4Q6NW29 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RWDD4Q6NW29 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RWDD4Q6NW29 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RWDD4Q6NW29 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RWDD4Q6NW29 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RWDD4Q6NW29 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RWDD4Q6NW29 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RWDD4Q6NW29 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RWDD4Q6NW29 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RWDD4Q6NW29 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RWDD4Q6NW29 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RWDD4Q6NW29 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RWDD4Q6NW29 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RWDD4Q6NW29 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RWDD4Q6NW29 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RWDD4Q6NW29 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RWDD4Q6NW29 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RWDD4Q6NW29 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RWDD4Q6NW29 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RWDD4Q6NW29 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RWDD4Q6NW29 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RWDD4Q6NW29 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RWDD4Q6NW29 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RWDD4Q6NW29 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RWDD4Q6NW29 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RWDD4Q6NW29 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RWDD4Q6NW29 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RWDD4Q6NW29 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RWDD4Q6NW29 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RWDD4Q6NW29 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RWDD4Q6NW29 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RWDD4Q6NW29 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RWDD4Q6NW29 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RWDD4Q6NW29 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RWDD4Q6NW29 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RWDD4Q6NW29 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RWDD4Q6NW29 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RWDD4Q6NW29 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RWDD4Q6NW29 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RWDD4Q6NW29 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RWDD4Q6NW29 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RWDD4Q6NW29 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RWDD4Q6NW29 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms