Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ55

TTBK2, Tau-tubulin kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTBK2Q6IQ55 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTBK2Q6IQ55 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTBK2Q6IQ55 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTBK2Q6IQ55 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTBK2Q6IQ55 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTBK2Q6IQ55 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TTBK2Q6IQ55 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TTBK2Q6IQ55 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTBK2Q6IQ55 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTBK2Q6IQ55 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTBK2Q6IQ55 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TTBK2Q6IQ55 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTBK2Q6IQ55 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTBK2Q6IQ55 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTBK2Q6IQ55 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTBK2Q6IQ55 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
TTBK2Q6IQ55 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTBK2Q6IQ55 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTBK2Q6IQ55 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTBK2Q6IQ55 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTBK2Q6IQ55 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTBK2Q6IQ55 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTBK2Q6IQ55 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTBK2Q6IQ55 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTBK2Q6IQ55 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTBK2Q6IQ55 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTBK2Q6IQ55 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTBK2Q6IQ55 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTBK2Q6IQ55 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTBK2Q6IQ55 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTBK2Q6IQ55 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTBK2Q6IQ55 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTBK2Q6IQ55 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTBK2Q6IQ55 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTBK2Q6IQ55 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTBK2Q6IQ55 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTBK2Q6IQ55 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TTBK2Q6IQ55 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TTBK2Q6IQ55 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TTBK2Q6IQ55 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TTBK2Q6IQ55 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TTBK2Q6IQ55 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TTBK2Q6IQ55 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TTBK2Q6IQ55 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TTBK2Q6IQ55 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TTBK2Q6IQ55 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TTBK2Q6IQ55 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TTBK2Q6IQ55 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTBK2Q6IQ55 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTBK2Q6IQ55 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TTBK2Q6IQ55 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTBK2Q6IQ55 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTBK2Q6IQ55 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
TTBK2Q6IQ55 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTBK2Q6IQ55 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTBK2Q6IQ55 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTBK2Q6IQ55 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTBK2Q6IQ55 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTBK2Q6IQ55 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTBK2Q6IQ55 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTBK2Q6IQ55 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTBK2Q6IQ55 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTBK2Q6IQ55 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTBK2Q6IQ55 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTBK2Q6IQ55 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTBK2Q6IQ55 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTBK2Q6IQ55 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTBK2Q6IQ55 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTBK2Q6IQ55 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTBK2Q6IQ55 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTBK2Q6IQ55 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTBK2Q6IQ55 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTBK2Q6IQ55 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTBK2Q6IQ55 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TTBK2Q6IQ55 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TTBK2Q6IQ55 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TTBK2Q6IQ55 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TTBK2Q6IQ55 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TTBK2Q6IQ55 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TTBK2Q6IQ55 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TTBK2Q6IQ55 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TTBK2Q6IQ55 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TTBK2Q6IQ55 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
TTBK2Q6IQ55 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTBK2Q6IQ55 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTBK2Q6IQ55 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTBK2Q6IQ55 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTBK2Q6IQ55 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTBK2Q6IQ55 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTBK2Q6IQ55 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTBK2Q6IQ55 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTBK2Q6IQ55 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTBK2Q6IQ55 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTBK2Q6IQ55 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTBK2Q6IQ55 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTBK2Q6IQ55 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TTBK2Q6IQ55 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TTBK2Q6IQ55 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TTBK2Q6IQ55 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TTBK2Q6IQ55 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms