Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPPQ6IPU0 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPPQ6IPU0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPPQ6IPU0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPPQ6IPU0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPPQ6IPU0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPPQ6IPU0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPPQ6IPU0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPPQ6IPU0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPPQ6IPU0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPPQ6IPU0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPPQ6IPU0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPPQ6IPU0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPPQ6IPU0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPPQ6IPU0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPPQ6IPU0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPPQ6IPU0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPPQ6IPU0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPPQ6IPU0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPPQ6IPU0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPPQ6IPU0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPPQ6IPU0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPPQ6IPU0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPPQ6IPU0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CENPPQ6IPU0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CENPPQ6IPU0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CENPPQ6IPU0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CENPPQ6IPU0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CENPPQ6IPU0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CENPPQ6IPU0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CENPPQ6IPU0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CENPPQ6IPU0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CENPPQ6IPU0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CENPPQ6IPU0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CENPPQ6IPU0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CENPPQ6IPU0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CENPPQ6IPU0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CENPPQ6IPU0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CENPPQ6IPU0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CENPPQ6IPU0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CENPPQ6IPU0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CENPPQ6IPU0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CENPPQ6IPU0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CENPPQ6IPU0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CENPPQ6IPU0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CENPPQ6IPU0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CENPPQ6IPU0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CENPPQ6IPU0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CENPPQ6IPU0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CENPPQ6IPU0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CENPPQ6IPU0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CENPPQ6IPU0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CENPPQ6IPU0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CENPPQ6IPU0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CENPPQ6IPU0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CENPPQ6IPU0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CENPPQ6IPU0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CENPPQ6IPU0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CENPPQ6IPU0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CENPPQ6IPU0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPPQ6IPU0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPPQ6IPU0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPPQ6IPU0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPPQ6IPU0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPPQ6IPU0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPPQ6IPU0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPPQ6IPU0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPPQ6IPU0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CENPPQ6IPU0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CENPPQ6IPU0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CENPPQ6IPU0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CENPPQ6IPU0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CENPPQ6IPU0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CENPPQ6IPU0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CENPPQ6IPU0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CENPPQ6IPU0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CENPPQ6IPU0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CENPPQ6IPU0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CENPPQ6IPU0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CENPPQ6IPU0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CENPPQ6IPU0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CENPPQ6IPU0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CENPPQ6IPU0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CENPPQ6IPU0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CENPPQ6IPU0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CENPPQ6IPU0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CENPPQ6IPU0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CENPPQ6IPU0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPPQ6IPU0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPPQ6IPU0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPPQ6IPU0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPPQ6IPU0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPPQ6IPU0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPPQ6IPU0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPPQ6IPU0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPPQ6IPU0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPPQ6IPU0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPPQ6IPU0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPPQ6IPU0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CENPPQ6IPU0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms