Protein–RNA interactions for Protein: Q6IEG0

SNRNP48, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 48 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP48Q6IEG0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNRNP48Q6IEG0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNRNP48Q6IEG0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNRNP48Q6IEG0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SNRNP48Q6IEG0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNRNP48Q6IEG0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNRNP48Q6IEG0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNRNP48Q6IEG0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNRNP48Q6IEG0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNRNP48Q6IEG0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNRNP48Q6IEG0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNRNP48Q6IEG0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SNRNP48Q6IEG0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNRNP48Q6IEG0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SNRNP48Q6IEG0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNRNP48Q6IEG0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNRNP48Q6IEG0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SNRNP48Q6IEG0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNRNP48Q6IEG0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNRNP48Q6IEG0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SNRNP48Q6IEG0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNRNP48Q6IEG0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNRNP48Q6IEG0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNRNP48Q6IEG0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNRNP48Q6IEG0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNRNP48Q6IEG0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNRNP48Q6IEG0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNRNP48Q6IEG0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNRNP48Q6IEG0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNRNP48Q6IEG0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNRNP48Q6IEG0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNRNP48Q6IEG0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNRNP48Q6IEG0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNRNP48Q6IEG0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNRNP48Q6IEG0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNRNP48Q6IEG0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNRNP48Q6IEG0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNRNP48Q6IEG0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNRNP48Q6IEG0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNRNP48Q6IEG0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNRNP48Q6IEG0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNRNP48Q6IEG0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNRNP48Q6IEG0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNRNP48Q6IEG0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNRNP48Q6IEG0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNRNP48Q6IEG0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNRNP48Q6IEG0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNRNP48Q6IEG0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNRNP48Q6IEG0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNRNP48Q6IEG0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNRNP48Q6IEG0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNRNP48Q6IEG0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNRNP48Q6IEG0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNRNP48Q6IEG0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNRNP48Q6IEG0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNRNP48Q6IEG0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNRNP48Q6IEG0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNRNP48Q6IEG0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNRNP48Q6IEG0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SNRNP48Q6IEG0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNRNP48Q6IEG0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SNRNP48Q6IEG0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SNRNP48Q6IEG0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNRNP48Q6IEG0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNRNP48Q6IEG0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SNRNP48Q6IEG0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNRNP48Q6IEG0 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNRNP48Q6IEG0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNRNP48Q6IEG0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNRNP48Q6IEG0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNRNP48Q6IEG0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNRNP48Q6IEG0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SNRNP48Q6IEG0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNRNP48Q6IEG0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNRNP48Q6IEG0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNRNP48Q6IEG0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNRNP48Q6IEG0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNRNP48Q6IEG0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNRNP48Q6IEG0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNRNP48Q6IEG0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNRNP48Q6IEG0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNRNP48Q6IEG0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNRNP48Q6IEG0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SNRNP48Q6IEG0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNRNP48Q6IEG0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNRNP48Q6IEG0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
SNRNP48Q6IEG0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNRNP48Q6IEG0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNRNP48Q6IEG0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNRNP48Q6IEG0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNRNP48Q6IEG0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNRNP48Q6IEG0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNRNP48Q6IEG0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNRNP48Q6IEG0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNRNP48Q6IEG0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNRNP48Q6IEG0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SNRNP48Q6IEG0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SNRNP48Q6IEG0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SNRNP48Q6IEG0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SNRNP48Q6IEG0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms