Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GRAMD4Q6IC98 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GRAMD4Q6IC98 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRAMD4Q6IC98 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRAMD4Q6IC98 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRAMD4Q6IC98 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GRAMD4Q6IC98 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRAMD4Q6IC98 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GRAMD4Q6IC98 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRAMD4Q6IC98 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRAMD4Q6IC98 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRAMD4Q6IC98 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRAMD4Q6IC98 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRAMD4Q6IC98 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRAMD4Q6IC98 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRAMD4Q6IC98 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRAMD4Q6IC98 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GRAMD4Q6IC98 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRAMD4Q6IC98 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GRAMD4Q6IC98 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GRAMD4Q6IC98 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRAMD4Q6IC98 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRAMD4Q6IC98 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRAMD4Q6IC98 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRAMD4Q6IC98 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRAMD4Q6IC98 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRAMD4Q6IC98 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRAMD4Q6IC98 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRAMD4Q6IC98 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRAMD4Q6IC98 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRAMD4Q6IC98 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRAMD4Q6IC98 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRAMD4Q6IC98 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRAMD4Q6IC98 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRAMD4Q6IC98 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRAMD4Q6IC98 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GRAMD4Q6IC98 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRAMD4Q6IC98 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRAMD4Q6IC98 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRAMD4Q6IC98 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRAMD4Q6IC98 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRAMD4Q6IC98 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRAMD4Q6IC98 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRAMD4Q6IC98 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRAMD4Q6IC98 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRAMD4Q6IC98 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRAMD4Q6IC98 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRAMD4Q6IC98 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRAMD4Q6IC98 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRAMD4Q6IC98 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRAMD4Q6IC98 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRAMD4Q6IC98 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRAMD4Q6IC98 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRAMD4Q6IC98 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRAMD4Q6IC98 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRAMD4Q6IC98 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRAMD4Q6IC98 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRAMD4Q6IC98 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRAMD4Q6IC98 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRAMD4Q6IC98 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRAMD4Q6IC98 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRAMD4Q6IC98 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRAMD4Q6IC98 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GRAMD4Q6IC98 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRAMD4Q6IC98 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRAMD4Q6IC98 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRAMD4Q6IC98 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRAMD4Q6IC98 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRAMD4Q6IC98 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRAMD4Q6IC98 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GRAMD4Q6IC98 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRAMD4Q6IC98 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRAMD4Q6IC98 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GRAMD4Q6IC98 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRAMD4Q6IC98 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRAMD4Q6IC98 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRAMD4Q6IC98 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRAMD4Q6IC98 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRAMD4Q6IC98 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRAMD4Q6IC98 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRAMD4Q6IC98 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRAMD4Q6IC98 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRAMD4Q6IC98 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRAMD4Q6IC98 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRAMD4Q6IC98 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRAMD4Q6IC98 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRAMD4Q6IC98 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRAMD4Q6IC98 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRAMD4Q6IC98 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GRAMD4Q6IC98 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRAMD4Q6IC98 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRAMD4Q6IC98 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRAMD4Q6IC98 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GRAMD4Q6IC98 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GRAMD4Q6IC98 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GRAMD4Q6IC98 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRAMD4Q6IC98 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRAMD4Q6IC98 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRAMD4Q6IC98 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GRAMD4Q6IC98 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms