Protein–RNA interactions for Protein: Q6GMV3

PTRHD1, Putative peptidyl-tRNA hydrolase PTRHD1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTRHD1Q6GMV3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTRHD1Q6GMV3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTRHD1Q6GMV3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTRHD1Q6GMV3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PTRHD1Q6GMV3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTRHD1Q6GMV3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTRHD1Q6GMV3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTRHD1Q6GMV3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTRHD1Q6GMV3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTRHD1Q6GMV3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTRHD1Q6GMV3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PTRHD1Q6GMV3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PTRHD1Q6GMV3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTRHD1Q6GMV3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTRHD1Q6GMV3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTRHD1Q6GMV3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTRHD1Q6GMV3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTRHD1Q6GMV3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTRHD1Q6GMV3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTRHD1Q6GMV3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTRHD1Q6GMV3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PTRHD1Q6GMV3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTRHD1Q6GMV3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTRHD1Q6GMV3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTRHD1Q6GMV3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTRHD1Q6GMV3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PTRHD1Q6GMV3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTRHD1Q6GMV3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTRHD1Q6GMV3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTRHD1Q6GMV3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTRHD1Q6GMV3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTRHD1Q6GMV3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTRHD1Q6GMV3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTRHD1Q6GMV3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTRHD1Q6GMV3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTRHD1Q6GMV3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTRHD1Q6GMV3 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTRHD1Q6GMV3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTRHD1Q6GMV3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTRHD1Q6GMV3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTRHD1Q6GMV3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTRHD1Q6GMV3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PTRHD1Q6GMV3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTRHD1Q6GMV3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTRHD1Q6GMV3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTRHD1Q6GMV3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTRHD1Q6GMV3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTRHD1Q6GMV3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTRHD1Q6GMV3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTRHD1Q6GMV3 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTRHD1Q6GMV3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTRHD1Q6GMV3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTRHD1Q6GMV3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTRHD1Q6GMV3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTRHD1Q6GMV3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTRHD1Q6GMV3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTRHD1Q6GMV3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTRHD1Q6GMV3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTRHD1Q6GMV3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTRHD1Q6GMV3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTRHD1Q6GMV3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTRHD1Q6GMV3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTRHD1Q6GMV3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTRHD1Q6GMV3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTRHD1Q6GMV3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTRHD1Q6GMV3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTRHD1Q6GMV3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTRHD1Q6GMV3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTRHD1Q6GMV3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTRHD1Q6GMV3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTRHD1Q6GMV3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTRHD1Q6GMV3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTRHD1Q6GMV3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTRHD1Q6GMV3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTRHD1Q6GMV3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTRHD1Q6GMV3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTRHD1Q6GMV3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTRHD1Q6GMV3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTRHD1Q6GMV3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTRHD1Q6GMV3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PTRHD1Q6GMV3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTRHD1Q6GMV3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTRHD1Q6GMV3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTRHD1Q6GMV3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTRHD1Q6GMV3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTRHD1Q6GMV3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTRHD1Q6GMV3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTRHD1Q6GMV3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTRHD1Q6GMV3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTRHD1Q6GMV3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTRHD1Q6GMV3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTRHD1Q6GMV3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTRHD1Q6GMV3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTRHD1Q6GMV3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTRHD1Q6GMV3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTRHD1Q6GMV3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTRHD1Q6GMV3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTRHD1Q6GMV3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTRHD1Q6GMV3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTRHD1Q6GMV3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms