Protein–RNA interactions for Protein: Q6AZZ1

TRIM68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM68Q6AZZ1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM68Q6AZZ1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM68Q6AZZ1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM68Q6AZZ1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM68Q6AZZ1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM68Q6AZZ1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM68Q6AZZ1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM68Q6AZZ1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM68Q6AZZ1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM68Q6AZZ1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM68Q6AZZ1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM68Q6AZZ1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM68Q6AZZ1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM68Q6AZZ1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM68Q6AZZ1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM68Q6AZZ1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM68Q6AZZ1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM68Q6AZZ1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM68Q6AZZ1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM68Q6AZZ1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM68Q6AZZ1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM68Q6AZZ1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM68Q6AZZ1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM68Q6AZZ1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM68Q6AZZ1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM68Q6AZZ1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM68Q6AZZ1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM68Q6AZZ1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM68Q6AZZ1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM68Q6AZZ1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM68Q6AZZ1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM68Q6AZZ1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM68Q6AZZ1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM68Q6AZZ1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM68Q6AZZ1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM68Q6AZZ1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM68Q6AZZ1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM68Q6AZZ1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM68Q6AZZ1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM68Q6AZZ1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM68Q6AZZ1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM68Q6AZZ1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM68Q6AZZ1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM68Q6AZZ1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM68Q6AZZ1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM68Q6AZZ1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM68Q6AZZ1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM68Q6AZZ1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM68Q6AZZ1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM68Q6AZZ1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM68Q6AZZ1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM68Q6AZZ1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM68Q6AZZ1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM68Q6AZZ1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM68Q6AZZ1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM68Q6AZZ1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM68Q6AZZ1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM68Q6AZZ1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM68Q6AZZ1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM68Q6AZZ1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM68Q6AZZ1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM68Q6AZZ1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM68Q6AZZ1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM68Q6AZZ1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM68Q6AZZ1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM68Q6AZZ1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM68Q6AZZ1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM68Q6AZZ1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM68Q6AZZ1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM68Q6AZZ1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM68Q6AZZ1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM68Q6AZZ1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM68Q6AZZ1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM68Q6AZZ1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM68Q6AZZ1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM68Q6AZZ1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM68Q6AZZ1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM68Q6AZZ1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM68Q6AZZ1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM68Q6AZZ1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM68Q6AZZ1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM68Q6AZZ1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM68Q6AZZ1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM68Q6AZZ1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM68Q6AZZ1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM68Q6AZZ1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM68Q6AZZ1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM68Q6AZZ1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM68Q6AZZ1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM68Q6AZZ1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM68Q6AZZ1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM68Q6AZZ1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM68Q6AZZ1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM68Q6AZZ1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM68Q6AZZ1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM68Q6AZZ1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM68Q6AZZ1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM68Q6AZZ1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM68Q6AZZ1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM68Q6AZZ1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms