Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DUPD1Q68J44 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DUPD1Q68J44 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DUPD1Q68J44 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DUPD1Q68J44 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DUPD1Q68J44 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DUPD1Q68J44 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DUPD1Q68J44 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
DUPD1Q68J44 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DUPD1Q68J44 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DUPD1Q68J44 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DUPD1Q68J44 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
DUPD1Q68J44 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
DUPD1Q68J44 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DUPD1Q68J44 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DUPD1Q68J44 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DUPD1Q68J44 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DUPD1Q68J44 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DUPD1Q68J44 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DUPD1Q68J44 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DUPD1Q68J44 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DUPD1Q68J44 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DUPD1Q68J44 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DUPD1Q68J44 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DUPD1Q68J44 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DUPD1Q68J44 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DUPD1Q68J44 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DUPD1Q68J44 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DUPD1Q68J44 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DUPD1Q68J44 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DUPD1Q68J44 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DUPD1Q68J44 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DUPD1Q68J44 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DUPD1Q68J44 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DUPD1Q68J44 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DUPD1Q68J44 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DUPD1Q68J44 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DUPD1Q68J44 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DUPD1Q68J44 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DUPD1Q68J44 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DUPD1Q68J44 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DUPD1Q68J44 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DUPD1Q68J44 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DUPD1Q68J44 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DUPD1Q68J44 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
DUPD1Q68J44 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DUPD1Q68J44 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DUPD1Q68J44 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DUPD1Q68J44 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DUPD1Q68J44 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DUPD1Q68J44 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DUPD1Q68J44 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DUPD1Q68J44 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DUPD1Q68J44 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DUPD1Q68J44 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DUPD1Q68J44 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DUPD1Q68J44 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DUPD1Q68J44 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DUPD1Q68J44 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DUPD1Q68J44 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DUPD1Q68J44 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DUPD1Q68J44 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DUPD1Q68J44 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DUPD1Q68J44 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DUPD1Q68J44 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DUPD1Q68J44 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DUPD1Q68J44 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DUPD1Q68J44 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
DUPD1Q68J44 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DUPD1Q68J44 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DUPD1Q68J44 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DUPD1Q68J44 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
DUPD1Q68J44 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DUPD1Q68J44 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DUPD1Q68J44 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DUPD1Q68J44 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DUPD1Q68J44 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DUPD1Q68J44 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DUPD1Q68J44 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DUPD1Q68J44 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DUPD1Q68J44 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DUPD1Q68J44 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DUPD1Q68J44 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DUPD1Q68J44 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DUPD1Q68J44 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DUPD1Q68J44 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DUPD1Q68J44 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DUPD1Q68J44 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DUPD1Q68J44 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DUPD1Q68J44 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DUPD1Q68J44 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DUPD1Q68J44 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DUPD1Q68J44 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DUPD1Q68J44 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DUPD1Q68J44 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DUPD1Q68J44 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DUPD1Q68J44 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DUPD1Q68J44 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DUPD1Q68J44 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DUPD1Q68J44 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms