Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
INTS3Q68E01 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
INTS3Q68E01 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
INTS3Q68E01 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
INTS3Q68E01 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
INTS3Q68E01 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
INTS3Q68E01 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
INTS3Q68E01 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
INTS3Q68E01 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
INTS3Q68E01 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
INTS3Q68E01 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
INTS3Q68E01 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
INTS3Q68E01 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
INTS3Q68E01 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
INTS3Q68E01 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
INTS3Q68E01 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
INTS3Q68E01 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
INTS3Q68E01 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
INTS3Q68E01 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
INTS3Q68E01 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
INTS3Q68E01 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
INTS3Q68E01 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
INTS3Q68E01 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
INTS3Q68E01 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
INTS3Q68E01 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
INTS3Q68E01 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
INTS3Q68E01 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
INTS3Q68E01 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
INTS3Q68E01 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
INTS3Q68E01 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
INTS3Q68E01 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
INTS3Q68E01 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
INTS3Q68E01 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
INTS3Q68E01 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
INTS3Q68E01 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
INTS3Q68E01 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
INTS3Q68E01 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
INTS3Q68E01 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
INTS3Q68E01 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
INTS3Q68E01 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
INTS3Q68E01 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
INTS3Q68E01 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
INTS3Q68E01 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
INTS3Q68E01 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
INTS3Q68E01 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
INTS3Q68E01 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
INTS3Q68E01 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
INTS3Q68E01 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
INTS3Q68E01 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
INTS3Q68E01 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
INTS3Q68E01 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
INTS3Q68E01 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
INTS3Q68E01 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
INTS3Q68E01 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
INTS3Q68E01 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
INTS3Q68E01 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
INTS3Q68E01 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
INTS3Q68E01 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
INTS3Q68E01 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
INTS3Q68E01 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
INTS3Q68E01 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
INTS3Q68E01 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
INTS3Q68E01 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
INTS3Q68E01 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
INTS3Q68E01 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
INTS3Q68E01 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
INTS3Q68E01 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
INTS3Q68E01 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
INTS3Q68E01 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
INTS3Q68E01 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
INTS3Q68E01 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
INTS3Q68E01 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
INTS3Q68E01 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
INTS3Q68E01 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
INTS3Q68E01 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
INTS3Q68E01 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
INTS3Q68E01 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
INTS3Q68E01 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
INTS3Q68E01 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
INTS3Q68E01 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
INTS3Q68E01 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
INTS3Q68E01 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
INTS3Q68E01 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
INTS3Q68E01 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
INTS3Q68E01 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
INTS3Q68E01 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
INTS3Q68E01 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
INTS3Q68E01 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
INTS3Q68E01 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
INTS3Q68E01 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
INTS3Q68E01 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
INTS3Q68E01 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
INTS3Q68E01 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
INTS3Q68E01 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
INTS3Q68E01 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
INTS3Q68E01 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
INTS3Q68E01 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
INTS3Q68E01 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
INTS3Q68E01 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
INTS3Q68E01 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms