Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RNF123Q5XPI4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
RNF123Q5XPI4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
RNF123Q5XPI4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RNF123Q5XPI4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RNF123Q5XPI4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RNF123Q5XPI4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RNF123Q5XPI4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RNF123Q5XPI4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RNF123Q5XPI4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
RNF123Q5XPI4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RNF123Q5XPI4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RNF123Q5XPI4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RNF123Q5XPI4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RNF123Q5XPI4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RNF123Q5XPI4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RNF123Q5XPI4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RNF123Q5XPI4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RNF123Q5XPI4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RNF123Q5XPI4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RNF123Q5XPI4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RNF123Q5XPI4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RNF123Q5XPI4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RNF123Q5XPI4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RNF123Q5XPI4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
RNF123Q5XPI4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
RNF123Q5XPI4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
RNF123Q5XPI4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RNF123Q5XPI4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RNF123Q5XPI4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
RNF123Q5XPI4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RNF123Q5XPI4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RNF123Q5XPI4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
RNF123Q5XPI4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RNF123Q5XPI4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
RNF123Q5XPI4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RNF123Q5XPI4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RNF123Q5XPI4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RNF123Q5XPI4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RNF123Q5XPI4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RNF123Q5XPI4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
RNF123Q5XPI4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
RNF123Q5XPI4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
RNF123Q5XPI4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RNF123Q5XPI4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RNF123Q5XPI4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RNF123Q5XPI4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
RNF123Q5XPI4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RNF123Q5XPI4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RNF123Q5XPI4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RNF123Q5XPI4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
RNF123Q5XPI4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RNF123Q5XPI4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RNF123Q5XPI4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RNF123Q5XPI4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RNF123Q5XPI4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RNF123Q5XPI4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
RNF123Q5XPI4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RNF123Q5XPI4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RNF123Q5XPI4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RNF123Q5XPI4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RNF123Q5XPI4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RNF123Q5XPI4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RNF123Q5XPI4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
RNF123Q5XPI4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
RNF123Q5XPI4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
RNF123Q5XPI4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
RNF123Q5XPI4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
RNF123Q5XPI4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
RNF123Q5XPI4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
RNF123Q5XPI4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RNF123Q5XPI4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
RNF123Q5XPI4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RNF123Q5XPI4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RNF123Q5XPI4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RNF123Q5XPI4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RNF123Q5XPI4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RNF123Q5XPI4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RNF123Q5XPI4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RNF123Q5XPI4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RNF123Q5XPI4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RNF123Q5XPI4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RNF123Q5XPI4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RNF123Q5XPI4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
RNF123Q5XPI4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RNF123Q5XPI4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
RNF123Q5XPI4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RNF123Q5XPI4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RNF123Q5XPI4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RNF123Q5XPI4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RNF123Q5XPI4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RNF123Q5XPI4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RNF123Q5XPI4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RNF123Q5XPI4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
RNF123Q5XPI4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RNF123Q5XPI4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RNF123Q5XPI4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RNF123Q5XPI4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
RNF123Q5XPI4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
RNF123Q5XPI4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms