Protein–RNA interactions for Protein: Q5W041

ARMC3, Armadillo repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARMC3Q5W041 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ARMC3Q5W041 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARMC3Q5W041 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARMC3Q5W041 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARMC3Q5W041 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARMC3Q5W041 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARMC3Q5W041 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARMC3Q5W041 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARMC3Q5W041 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARMC3Q5W041 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARMC3Q5W041 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARMC3Q5W041 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARMC3Q5W041 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARMC3Q5W041 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARMC3Q5W041 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ARMC3Q5W041 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARMC3Q5W041 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARMC3Q5W041 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARMC3Q5W041 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARMC3Q5W041 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARMC3Q5W041 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARMC3Q5W041 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARMC3Q5W041 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARMC3Q5W041 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARMC3Q5W041 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARMC3Q5W041 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARMC3Q5W041 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARMC3Q5W041 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARMC3Q5W041 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARMC3Q5W041 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ARMC3Q5W041 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ARMC3Q5W041 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ARMC3Q5W041 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARMC3Q5W041 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARMC3Q5W041 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARMC3Q5W041 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARMC3Q5W041 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARMC3Q5W041 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARMC3Q5W041 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARMC3Q5W041 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARMC3Q5W041 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARMC3Q5W041 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARMC3Q5W041 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARMC3Q5W041 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARMC3Q5W041 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARMC3Q5W041 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARMC3Q5W041 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARMC3Q5W041 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARMC3Q5W041 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARMC3Q5W041 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARMC3Q5W041 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARMC3Q5W041 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARMC3Q5W041 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARMC3Q5W041 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARMC3Q5W041 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARMC3Q5W041 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARMC3Q5W041 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARMC3Q5W041 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARMC3Q5W041 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARMC3Q5W041 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARMC3Q5W041 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARMC3Q5W041 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ARMC3Q5W041 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARMC3Q5W041 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARMC3Q5W041 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARMC3Q5W041 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARMC3Q5W041 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARMC3Q5W041 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARMC3Q5W041 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARMC3Q5W041 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARMC3Q5W041 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARMC3Q5W041 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARMC3Q5W041 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARMC3Q5W041 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARMC3Q5W041 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARMC3Q5W041 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARMC3Q5W041 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARMC3Q5W041 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARMC3Q5W041 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARMC3Q5W041 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARMC3Q5W041 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARMC3Q5W041 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARMC3Q5W041 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARMC3Q5W041 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARMC3Q5W041 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARMC3Q5W041 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARMC3Q5W041 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARMC3Q5W041 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARMC3Q5W041 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARMC3Q5W041 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARMC3Q5W041 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ARMC3Q5W041 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ARMC3Q5W041 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARMC3Q5W041 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ARMC3Q5W041 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARMC3Q5W041 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARMC3Q5W041 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARMC3Q5W041 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARMC3Q5W041 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARMC3Q5W041 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms