Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SUSD4Q5VX71 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SUSD4Q5VX71 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SUSD4Q5VX71 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SUSD4Q5VX71 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SUSD4Q5VX71 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SUSD4Q5VX71 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SUSD4Q5VX71 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SUSD4Q5VX71 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SUSD4Q5VX71 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SUSD4Q5VX71 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SUSD4Q5VX71 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SUSD4Q5VX71 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SUSD4Q5VX71 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SUSD4Q5VX71 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SUSD4Q5VX71 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SUSD4Q5VX71 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SUSD4Q5VX71 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SUSD4Q5VX71 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SUSD4Q5VX71 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SUSD4Q5VX71 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SUSD4Q5VX71 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SUSD4Q5VX71 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SUSD4Q5VX71 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SUSD4Q5VX71 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SUSD4Q5VX71 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SUSD4Q5VX71 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SUSD4Q5VX71 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SUSD4Q5VX71 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SUSD4Q5VX71 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SUSD4Q5VX71 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SUSD4Q5VX71 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SUSD4Q5VX71 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SUSD4Q5VX71 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SUSD4Q5VX71 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SUSD4Q5VX71 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SUSD4Q5VX71 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SUSD4Q5VX71 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SUSD4Q5VX71 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SUSD4Q5VX71 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
SUSD4Q5VX71 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SUSD4Q5VX71 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SUSD4Q5VX71 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SUSD4Q5VX71 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SUSD4Q5VX71 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SUSD4Q5VX71 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SUSD4Q5VX71 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SUSD4Q5VX71 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SUSD4Q5VX71 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SUSD4Q5VX71 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SUSD4Q5VX71 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SUSD4Q5VX71 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SUSD4Q5VX71 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SUSD4Q5VX71 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SUSD4Q5VX71 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SUSD4Q5VX71 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SUSD4Q5VX71 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SUSD4Q5VX71 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SUSD4Q5VX71 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SUSD4Q5VX71 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SUSD4Q5VX71 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SUSD4Q5VX71 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SUSD4Q5VX71 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SUSD4Q5VX71 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SUSD4Q5VX71 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SUSD4Q5VX71 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SUSD4Q5VX71 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SUSD4Q5VX71 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SUSD4Q5VX71 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SUSD4Q5VX71 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SUSD4Q5VX71 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SUSD4Q5VX71 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SUSD4Q5VX71 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SUSD4Q5VX71 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SUSD4Q5VX71 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SUSD4Q5VX71 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
SUSD4Q5VX71 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SUSD4Q5VX71 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SUSD4Q5VX71 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SUSD4Q5VX71 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SUSD4Q5VX71 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SUSD4Q5VX71 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SUSD4Q5VX71 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SUSD4Q5VX71 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SUSD4Q5VX71 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SUSD4Q5VX71 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SUSD4Q5VX71 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SUSD4Q5VX71 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SUSD4Q5VX71 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SUSD4Q5VX71 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SUSD4Q5VX71 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SUSD4Q5VX71 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SUSD4Q5VX71 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SUSD4Q5VX71 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SUSD4Q5VX71 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SUSD4Q5VX71 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SUSD4Q5VX71 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SUSD4Q5VX71 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SUSD4Q5VX71 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SUSD4Q5VX71 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.3 ms