Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGS1

HES3, Transcription factor HES-3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES3Q5TGS1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HES3Q5TGS1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HES3Q5TGS1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HES3Q5TGS1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HES3Q5TGS1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HES3Q5TGS1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HES3Q5TGS1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HES3Q5TGS1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HES3Q5TGS1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HES3Q5TGS1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HES3Q5TGS1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HES3Q5TGS1 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HES3Q5TGS1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HES3Q5TGS1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HES3Q5TGS1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HES3Q5TGS1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HES3Q5TGS1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HES3Q5TGS1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HES3Q5TGS1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HES3Q5TGS1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HES3Q5TGS1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HES3Q5TGS1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HES3Q5TGS1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HES3Q5TGS1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HES3Q5TGS1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HES3Q5TGS1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HES3Q5TGS1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HES3Q5TGS1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HES3Q5TGS1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HES3Q5TGS1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HES3Q5TGS1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HES3Q5TGS1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HES3Q5TGS1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HES3Q5TGS1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HES3Q5TGS1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HES3Q5TGS1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HES3Q5TGS1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HES3Q5TGS1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HES3Q5TGS1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HES3Q5TGS1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HES3Q5TGS1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HES3Q5TGS1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HES3Q5TGS1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HES3Q5TGS1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HES3Q5TGS1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HES3Q5TGS1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HES3Q5TGS1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HES3Q5TGS1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HES3Q5TGS1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HES3Q5TGS1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HES3Q5TGS1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HES3Q5TGS1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HES3Q5TGS1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HES3Q5TGS1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HES3Q5TGS1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HES3Q5TGS1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HES3Q5TGS1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HES3Q5TGS1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HES3Q5TGS1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HES3Q5TGS1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HES3Q5TGS1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HES3Q5TGS1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HES3Q5TGS1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HES3Q5TGS1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HES3Q5TGS1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HES3Q5TGS1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HES3Q5TGS1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HES3Q5TGS1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HES3Q5TGS1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HES3Q5TGS1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HES3Q5TGS1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HES3Q5TGS1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HES3Q5TGS1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HES3Q5TGS1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HES3Q5TGS1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HES3Q5TGS1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HES3Q5TGS1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HES3Q5TGS1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HES3Q5TGS1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HES3Q5TGS1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HES3Q5TGS1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HES3Q5TGS1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HES3Q5TGS1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HES3Q5TGS1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HES3Q5TGS1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HES3Q5TGS1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HES3Q5TGS1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HES3Q5TGS1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HES3Q5TGS1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HES3Q5TGS1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HES3Q5TGS1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HES3Q5TGS1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HES3Q5TGS1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HES3Q5TGS1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HES3Q5TGS1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HES3Q5TGS1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HES3Q5TGS1 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HES3Q5TGS1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HES3Q5TGS1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HES3Q5TGS1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms