Protein–RNA interactions for Protein: Q5TA31

RNF187, E3 ubiquitin-protein ligase RNF187, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF187Q5TA31 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF187Q5TA31 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF187Q5TA31 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF187Q5TA31 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF187Q5TA31 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF187Q5TA31 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF187Q5TA31 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF187Q5TA31 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF187Q5TA31 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF187Q5TA31 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RNF187Q5TA31 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF187Q5TA31 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF187Q5TA31 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF187Q5TA31 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF187Q5TA31 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF187Q5TA31 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF187Q5TA31 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF187Q5TA31 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF187Q5TA31 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF187Q5TA31 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF187Q5TA31 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF187Q5TA31 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF187Q5TA31 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RNF187Q5TA31 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RNF187Q5TA31 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RNF187Q5TA31 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF187Q5TA31 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF187Q5TA31 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF187Q5TA31 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF187Q5TA31 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF187Q5TA31 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF187Q5TA31 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF187Q5TA31 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF187Q5TA31 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF187Q5TA31 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RNF187Q5TA31 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF187Q5TA31 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF187Q5TA31 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF187Q5TA31 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF187Q5TA31 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RNF187Q5TA31 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF187Q5TA31 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF187Q5TA31 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF187Q5TA31 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF187Q5TA31 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF187Q5TA31 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF187Q5TA31 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF187Q5TA31 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF187Q5TA31 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF187Q5TA31 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RNF187Q5TA31 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF187Q5TA31 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF187Q5TA31 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF187Q5TA31 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF187Q5TA31 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF187Q5TA31 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF187Q5TA31 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF187Q5TA31 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF187Q5TA31 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF187Q5TA31 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF187Q5TA31 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF187Q5TA31 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF187Q5TA31 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF187Q5TA31 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF187Q5TA31 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RNF187Q5TA31 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF187Q5TA31 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF187Q5TA31 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF187Q5TA31 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF187Q5TA31 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RNF187Q5TA31 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF187Q5TA31 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF187Q5TA31 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF187Q5TA31 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF187Q5TA31 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF187Q5TA31 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF187Q5TA31 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF187Q5TA31 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RNF187Q5TA31 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RNF187Q5TA31 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RNF187Q5TA31 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RNF187Q5TA31 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RNF187Q5TA31 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RNF187Q5TA31 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF187Q5TA31 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF187Q5TA31 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF187Q5TA31 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF187Q5TA31 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF187Q5TA31 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF187Q5TA31 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RNF187Q5TA31 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF187Q5TA31 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF187Q5TA31 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF187Q5TA31 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF187Q5TA31 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF187Q5TA31 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF187Q5TA31 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF187Q5TA31 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF187Q5TA31 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RNF187Q5TA31 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms