Protein–RNA interactions for Protein: Q5T200

ZC3H13, Zinc finger CCCH domain-containing protein 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H13Q5T200 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
ZC3H13Q5T200 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ZC3H13Q5T200 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ZC3H13Q5T200 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ZC3H13Q5T200 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ZC3H13Q5T200 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ZC3H13Q5T200 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ZC3H13Q5T200 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ZC3H13Q5T200 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ZC3H13Q5T200 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ZC3H13Q5T200 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ZC3H13Q5T200 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ZC3H13Q5T200 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ZC3H13Q5T200 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ZC3H13Q5T200 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
ZC3H13Q5T200 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
ZC3H13Q5T200 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ZC3H13Q5T200 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
ZC3H13Q5T200 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ZC3H13Q5T200 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
ZC3H13Q5T200 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
ZC3H13Q5T200 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ZC3H13Q5T200 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
ZC3H13Q5T200 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
ZC3H13Q5T200 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
ZC3H13Q5T200 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ZC3H13Q5T200 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ZC3H13Q5T200 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ZC3H13Q5T200 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
ZC3H13Q5T200 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ZC3H13Q5T200 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ZC3H13Q5T200 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ZC3H13Q5T200 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ZC3H13Q5T200 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ZC3H13Q5T200 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ZC3H13Q5T200 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ZC3H13Q5T200 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
ZC3H13Q5T200 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
ZC3H13Q5T200 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
ZC3H13Q5T200 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
ZC3H13Q5T200 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ZC3H13Q5T200 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ZC3H13Q5T200 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ZC3H13Q5T200 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ZC3H13Q5T200 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ZC3H13Q5T200 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
ZC3H13Q5T200 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
ZC3H13Q5T200 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
ZC3H13Q5T200 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
ZC3H13Q5T200 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
ZC3H13Q5T200 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
ZC3H13Q5T200 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
ZC3H13Q5T200 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ZC3H13Q5T200 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ZC3H13Q5T200 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ZC3H13Q5T200 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ZC3H13Q5T200 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ZC3H13Q5T200 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ZC3H13Q5T200 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ZC3H13Q5T200 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ZC3H13Q5T200 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ZC3H13Q5T200 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ZC3H13Q5T200 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ZC3H13Q5T200 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ZC3H13Q5T200 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ZC3H13Q5T200 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ZC3H13Q5T200 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ZC3H13Q5T200 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ZC3H13Q5T200 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ZC3H13Q5T200 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ZC3H13Q5T200 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
ZC3H13Q5T200 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
ZC3H13Q5T200 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ZC3H13Q5T200 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ZC3H13Q5T200 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ZC3H13Q5T200 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
ZC3H13Q5T200 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
ZC3H13Q5T200 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
ZC3H13Q5T200 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
ZC3H13Q5T200 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ZC3H13Q5T200 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ZC3H13Q5T200 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ZC3H13Q5T200 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ZC3H13Q5T200 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ZC3H13Q5T200 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ZC3H13Q5T200 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ZC3H13Q5T200 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ZC3H13Q5T200 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ZC3H13Q5T200 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
ZC3H13Q5T200 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
ZC3H13Q5T200 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ZC3H13Q5T200 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ZC3H13Q5T200 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ZC3H13Q5T200 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ZC3H13Q5T200 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ZC3H13Q5T200 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
ZC3H13Q5T200 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC33.82■■■■□ 3
ZC3H13Q5T200 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
ZC3H13Q5T200 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
ZC3H13Q5T200 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms