Protein–RNA interactions for Protein: Q5T124

UBXN11, UBX domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN11Q5T124 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBXN11Q5T124 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBXN11Q5T124 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBXN11Q5T124 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBXN11Q5T124 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBXN11Q5T124 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBXN11Q5T124 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBXN11Q5T124 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBXN11Q5T124 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBXN11Q5T124 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBXN11Q5T124 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBXN11Q5T124 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBXN11Q5T124 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBXN11Q5T124 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBXN11Q5T124 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
UBXN11Q5T124 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBXN11Q5T124 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBXN11Q5T124 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBXN11Q5T124 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBXN11Q5T124 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBXN11Q5T124 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBXN11Q5T124 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBXN11Q5T124 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBXN11Q5T124 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBXN11Q5T124 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
UBXN11Q5T124 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
UBXN11Q5T124 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25■■□□□ 1.59
UBXN11Q5T124 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBXN11Q5T124 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBXN11Q5T124 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBXN11Q5T124 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBXN11Q5T124 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBXN11Q5T124 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBXN11Q5T124 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBXN11Q5T124 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBXN11Q5T124 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBXN11Q5T124 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBXN11Q5T124 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBXN11Q5T124 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBXN11Q5T124 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBXN11Q5T124 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBXN11Q5T124 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBXN11Q5T124 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBXN11Q5T124 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBXN11Q5T124 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBXN11Q5T124 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBXN11Q5T124 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBXN11Q5T124 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBXN11Q5T124 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBXN11Q5T124 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBXN11Q5T124 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBXN11Q5T124 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBXN11Q5T124 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBXN11Q5T124 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBXN11Q5T124 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBXN11Q5T124 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBXN11Q5T124 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBXN11Q5T124 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBXN11Q5T124 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBXN11Q5T124 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBXN11Q5T124 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBXN11Q5T124 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBXN11Q5T124 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBXN11Q5T124 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBXN11Q5T124 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBXN11Q5T124 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBXN11Q5T124 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
UBXN11Q5T124 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBXN11Q5T124 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBXN11Q5T124 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBXN11Q5T124 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBXN11Q5T124 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBXN11Q5T124 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBXN11Q5T124 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBXN11Q5T124 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBXN11Q5T124 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBXN11Q5T124 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBXN11Q5T124 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBXN11Q5T124 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBXN11Q5T124 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBXN11Q5T124 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBXN11Q5T124 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBXN11Q5T124 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBXN11Q5T124 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
UBXN11Q5T124 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBXN11Q5T124 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBXN11Q5T124 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBXN11Q5T124 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBXN11Q5T124 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBXN11Q5T124 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBXN11Q5T124 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBXN11Q5T124 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBXN11Q5T124 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBXN11Q5T124 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBXN11Q5T124 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBXN11Q5T124 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBXN11Q5T124 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
UBXN11Q5T124 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBXN11Q5T124 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBXN11Q5T124 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms