Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LDLRAP1Q5SW96 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LDLRAP1Q5SW96 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDLRAP1Q5SW96 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDLRAP1Q5SW96 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDLRAP1Q5SW96 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDLRAP1Q5SW96 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDLRAP1Q5SW96 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDLRAP1Q5SW96 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDLRAP1Q5SW96 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDLRAP1Q5SW96 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDLRAP1Q5SW96 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LDLRAP1Q5SW96 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDLRAP1Q5SW96 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDLRAP1Q5SW96 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDLRAP1Q5SW96 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDLRAP1Q5SW96 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDLRAP1Q5SW96 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDLRAP1Q5SW96 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LDLRAP1Q5SW96 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LDLRAP1Q5SW96 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LDLRAP1Q5SW96 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms