Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PERM1Q5SV97 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PERM1Q5SV97 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PERM1Q5SV97 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PERM1Q5SV97 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PERM1Q5SV97 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PERM1Q5SV97 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PERM1Q5SV97 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PERM1Q5SV97 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PERM1Q5SV97 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PERM1Q5SV97 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PERM1Q5SV97 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PERM1Q5SV97 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PERM1Q5SV97 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PERM1Q5SV97 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PERM1Q5SV97 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PERM1Q5SV97 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PERM1Q5SV97 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PERM1Q5SV97 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PERM1Q5SV97 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PERM1Q5SV97 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PERM1Q5SV97 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PERM1Q5SV97 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PERM1Q5SV97 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PERM1Q5SV97 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PERM1Q5SV97 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PERM1Q5SV97 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PERM1Q5SV97 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PERM1Q5SV97 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PERM1Q5SV97 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PERM1Q5SV97 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PERM1Q5SV97 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PERM1Q5SV97 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PERM1Q5SV97 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PERM1Q5SV97 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PERM1Q5SV97 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PERM1Q5SV97 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PERM1Q5SV97 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PERM1Q5SV97 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PERM1Q5SV97 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PERM1Q5SV97 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PERM1Q5SV97 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PERM1Q5SV97 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PERM1Q5SV97 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PERM1Q5SV97 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PERM1Q5SV97 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PERM1Q5SV97 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PERM1Q5SV97 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PERM1Q5SV97 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PERM1Q5SV97 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PERM1Q5SV97 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PERM1Q5SV97 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PERM1Q5SV97 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PERM1Q5SV97 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PERM1Q5SV97 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PERM1Q5SV97 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PERM1Q5SV97 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PERM1Q5SV97 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PERM1Q5SV97 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PERM1Q5SV97 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PERM1Q5SV97 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PERM1Q5SV97 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PERM1Q5SV97 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PERM1Q5SV97 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PERM1Q5SV97 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PERM1Q5SV97 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PERM1Q5SV97 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PERM1Q5SV97 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PERM1Q5SV97 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PERM1Q5SV97 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PERM1Q5SV97 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PERM1Q5SV97 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PERM1Q5SV97 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PERM1Q5SV97 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PERM1Q5SV97 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PERM1Q5SV97 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PERM1Q5SV97 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PERM1Q5SV97 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PERM1Q5SV97 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PERM1Q5SV97 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PERM1Q5SV97 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PERM1Q5SV97 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PERM1Q5SV97 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PERM1Q5SV97 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PERM1Q5SV97 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PERM1Q5SV97 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PERM1Q5SV97 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PERM1Q5SV97 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PERM1Q5SV97 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PERM1Q5SV97 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PERM1Q5SV97 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PERM1Q5SV97 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PERM1Q5SV97 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PERM1Q5SV97 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PERM1Q5SV97 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PERM1Q5SV97 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PERM1Q5SV97 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PERM1Q5SV97 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PERM1Q5SV97 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PERM1Q5SV97 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms