Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVS0

HABP4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HABP4Q5JVS0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HABP4Q5JVS0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HABP4Q5JVS0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HABP4Q5JVS0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
HABP4Q5JVS0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HABP4Q5JVS0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HABP4Q5JVS0 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
HABP4Q5JVS0 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
HABP4Q5JVS0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HABP4Q5JVS0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HABP4Q5JVS0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HABP4Q5JVS0 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HABP4Q5JVS0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HABP4Q5JVS0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
HABP4Q5JVS0 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HABP4Q5JVS0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HABP4Q5JVS0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HABP4Q5JVS0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HABP4Q5JVS0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HABP4Q5JVS0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HABP4Q5JVS0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HABP4Q5JVS0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HABP4Q5JVS0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HABP4Q5JVS0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HABP4Q5JVS0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HABP4Q5JVS0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HABP4Q5JVS0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
HABP4Q5JVS0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
HABP4Q5JVS0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HABP4Q5JVS0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HABP4Q5JVS0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HABP4Q5JVS0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HABP4Q5JVS0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HABP4Q5JVS0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HABP4Q5JVS0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HABP4Q5JVS0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HABP4Q5JVS0 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
HABP4Q5JVS0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HABP4Q5JVS0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HABP4Q5JVS0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HABP4Q5JVS0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HABP4Q5JVS0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HABP4Q5JVS0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HABP4Q5JVS0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HABP4Q5JVS0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HABP4Q5JVS0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HABP4Q5JVS0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
HABP4Q5JVS0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HABP4Q5JVS0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HABP4Q5JVS0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HABP4Q5JVS0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HABP4Q5JVS0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HABP4Q5JVS0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HABP4Q5JVS0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HABP4Q5JVS0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HABP4Q5JVS0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HABP4Q5JVS0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HABP4Q5JVS0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HABP4Q5JVS0 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HABP4Q5JVS0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HABP4Q5JVS0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HABP4Q5JVS0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HABP4Q5JVS0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HABP4Q5JVS0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HABP4Q5JVS0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HABP4Q5JVS0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HABP4Q5JVS0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HABP4Q5JVS0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HABP4Q5JVS0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HABP4Q5JVS0 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HABP4Q5JVS0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HABP4Q5JVS0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HABP4Q5JVS0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HABP4Q5JVS0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HABP4Q5JVS0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HABP4Q5JVS0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HABP4Q5JVS0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HABP4Q5JVS0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HABP4Q5JVS0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
HABP4Q5JVS0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
HABP4Q5JVS0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HABP4Q5JVS0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HABP4Q5JVS0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HABP4Q5JVS0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HABP4Q5JVS0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HABP4Q5JVS0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HABP4Q5JVS0 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HABP4Q5JVS0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HABP4Q5JVS0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HABP4Q5JVS0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HABP4Q5JVS0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HABP4Q5JVS0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HABP4Q5JVS0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HABP4Q5JVS0 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HABP4Q5JVS0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HABP4Q5JVS0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HABP4Q5JVS0 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HABP4Q5JVS0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HABP4Q5JVS0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HABP4Q5JVS0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms