Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVL4

EFHC1, EF-hand domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHC1Q5JVL4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFHC1Q5JVL4 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFHC1Q5JVL4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFHC1Q5JVL4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFHC1Q5JVL4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFHC1Q5JVL4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFHC1Q5JVL4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
EFHC1Q5JVL4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EFHC1Q5JVL4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EFHC1Q5JVL4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EFHC1Q5JVL4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EFHC1Q5JVL4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EFHC1Q5JVL4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EFHC1Q5JVL4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
EFHC1Q5JVL4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EFHC1Q5JVL4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
EFHC1Q5JVL4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EFHC1Q5JVL4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EFHC1Q5JVL4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EFHC1Q5JVL4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFHC1Q5JVL4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFHC1Q5JVL4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFHC1Q5JVL4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFHC1Q5JVL4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFHC1Q5JVL4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFHC1Q5JVL4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFHC1Q5JVL4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFHC1Q5JVL4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFHC1Q5JVL4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFHC1Q5JVL4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EFHC1Q5JVL4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EFHC1Q5JVL4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EFHC1Q5JVL4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EFHC1Q5JVL4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EFHC1Q5JVL4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EFHC1Q5JVL4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EFHC1Q5JVL4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EFHC1Q5JVL4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EFHC1Q5JVL4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EFHC1Q5JVL4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EFHC1Q5JVL4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EFHC1Q5JVL4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EFHC1Q5JVL4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EFHC1Q5JVL4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EFHC1Q5JVL4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EFHC1Q5JVL4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
EFHC1Q5JVL4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
EFHC1Q5JVL4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EFHC1Q5JVL4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EFHC1Q5JVL4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EFHC1Q5JVL4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EFHC1Q5JVL4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EFHC1Q5JVL4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EFHC1Q5JVL4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EFHC1Q5JVL4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EFHC1Q5JVL4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EFHC1Q5JVL4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EFHC1Q5JVL4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EFHC1Q5JVL4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
EFHC1Q5JVL4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EFHC1Q5JVL4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EFHC1Q5JVL4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EFHC1Q5JVL4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EFHC1Q5JVL4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EFHC1Q5JVL4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EFHC1Q5JVL4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFHC1Q5JVL4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFHC1Q5JVL4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFHC1Q5JVL4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFHC1Q5JVL4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFHC1Q5JVL4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFHC1Q5JVL4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFHC1Q5JVL4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFHC1Q5JVL4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFHC1Q5JVL4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFHC1Q5JVL4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFHC1Q5JVL4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFHC1Q5JVL4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFHC1Q5JVL4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFHC1Q5JVL4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFHC1Q5JVL4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
EFHC1Q5JVL4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFHC1Q5JVL4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFHC1Q5JVL4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFHC1Q5JVL4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFHC1Q5JVL4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFHC1Q5JVL4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFHC1Q5JVL4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFHC1Q5JVL4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFHC1Q5JVL4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFHC1Q5JVL4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFHC1Q5JVL4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFHC1Q5JVL4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFHC1Q5JVL4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFHC1Q5JVL4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFHC1Q5JVL4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFHC1Q5JVL4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFHC1Q5JVL4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFHC1Q5JVL4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFHC1Q5JVL4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms