Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KCNT1Q5JUK3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNT1Q5JUK3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNT1Q5JUK3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNT1Q5JUK3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNT1Q5JUK3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNT1Q5JUK3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNT1Q5JUK3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNT1Q5JUK3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNT1Q5JUK3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KCNT1Q5JUK3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNT1Q5JUK3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNT1Q5JUK3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNT1Q5JUK3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNT1Q5JUK3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNT1Q5JUK3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KCNT1Q5JUK3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNT1Q5JUK3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNT1Q5JUK3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNT1Q5JUK3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KCNT1Q5JUK3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNT1Q5JUK3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNT1Q5JUK3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNT1Q5JUK3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNT1Q5JUK3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNT1Q5JUK3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNT1Q5JUK3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNT1Q5JUK3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNT1Q5JUK3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KCNT1Q5JUK3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNT1Q5JUK3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNT1Q5JUK3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNT1Q5JUK3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNT1Q5JUK3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNT1Q5JUK3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNT1Q5JUK3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNT1Q5JUK3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNT1Q5JUK3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNT1Q5JUK3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNT1Q5JUK3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KCNT1Q5JUK3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNT1Q5JUK3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNT1Q5JUK3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNT1Q5JUK3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNT1Q5JUK3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNT1Q5JUK3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNT1Q5JUK3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNT1Q5JUK3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNT1Q5JUK3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNT1Q5JUK3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNT1Q5JUK3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KCNT1Q5JUK3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNT1Q5JUK3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNT1Q5JUK3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNT1Q5JUK3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNT1Q5JUK3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNT1Q5JUK3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNT1Q5JUK3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNT1Q5JUK3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KCNT1Q5JUK3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KCNT1Q5JUK3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KCNT1Q5JUK3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNT1Q5JUK3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNT1Q5JUK3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNT1Q5JUK3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNT1Q5JUK3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNT1Q5JUK3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNT1Q5JUK3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNT1Q5JUK3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNT1Q5JUK3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNT1Q5JUK3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
KCNT1Q5JUK3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNT1Q5JUK3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNT1Q5JUK3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNT1Q5JUK3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNT1Q5JUK3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNT1Q5JUK3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNT1Q5JUK3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNT1Q5JUK3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNT1Q5JUK3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNT1Q5JUK3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNT1Q5JUK3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNT1Q5JUK3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNT1Q5JUK3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNT1Q5JUK3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KCNT1Q5JUK3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNT1Q5JUK3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNT1Q5JUK3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNT1Q5JUK3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNT1Q5JUK3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNT1Q5JUK3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNT1Q5JUK3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNT1Q5JUK3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNT1Q5JUK3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNT1Q5JUK3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNT1Q5JUK3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNT1Q5JUK3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNT1Q5JUK3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KCNT1Q5JUK3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KCNT1Q5JUK3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms