Protein–RNA interactions for Protein: Q5J8X5

MS4A13, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 13, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A13Q5J8X5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MS4A13Q5J8X5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
MS4A13Q5J8X5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MS4A13Q5J8X5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MS4A13Q5J8X5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MS4A13Q5J8X5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MS4A13Q5J8X5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MS4A13Q5J8X5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MS4A13Q5J8X5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MS4A13Q5J8X5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MS4A13Q5J8X5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MS4A13Q5J8X5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MS4A13Q5J8X5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MS4A13Q5J8X5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MS4A13Q5J8X5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
MS4A13Q5J8X5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MS4A13Q5J8X5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MS4A13Q5J8X5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MS4A13Q5J8X5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MS4A13Q5J8X5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MS4A13Q5J8X5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MS4A13Q5J8X5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MS4A13Q5J8X5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MS4A13Q5J8X5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MS4A13Q5J8X5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MS4A13Q5J8X5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
MS4A13Q5J8X5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
MS4A13Q5J8X5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
MS4A13Q5J8X5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MS4A13Q5J8X5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
MS4A13Q5J8X5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MS4A13Q5J8X5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MS4A13Q5J8X5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MS4A13Q5J8X5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MS4A13Q5J8X5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MS4A13Q5J8X5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MS4A13Q5J8X5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MS4A13Q5J8X5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MS4A13Q5J8X5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MS4A13Q5J8X5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MS4A13Q5J8X5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MS4A13Q5J8X5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MS4A13Q5J8X5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MS4A13Q5J8X5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MS4A13Q5J8X5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MS4A13Q5J8X5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MS4A13Q5J8X5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MS4A13Q5J8X5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MS4A13Q5J8X5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MS4A13Q5J8X5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MS4A13Q5J8X5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MS4A13Q5J8X5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MS4A13Q5J8X5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MS4A13Q5J8X5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MS4A13Q5J8X5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MS4A13Q5J8X5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MS4A13Q5J8X5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MS4A13Q5J8X5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MS4A13Q5J8X5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MS4A13Q5J8X5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MS4A13Q5J8X5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MS4A13Q5J8X5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MS4A13Q5J8X5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MS4A13Q5J8X5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MS4A13Q5J8X5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MS4A13Q5J8X5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MS4A13Q5J8X5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MS4A13Q5J8X5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MS4A13Q5J8X5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MS4A13Q5J8X5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MS4A13Q5J8X5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MS4A13Q5J8X5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MS4A13Q5J8X5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MS4A13Q5J8X5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MS4A13Q5J8X5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MS4A13Q5J8X5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MS4A13Q5J8X5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MS4A13Q5J8X5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MS4A13Q5J8X5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MS4A13Q5J8X5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MS4A13Q5J8X5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MS4A13Q5J8X5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MS4A13Q5J8X5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MS4A13Q5J8X5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MS4A13Q5J8X5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MS4A13Q5J8X5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MS4A13Q5J8X5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MS4A13Q5J8X5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MS4A13Q5J8X5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MS4A13Q5J8X5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MS4A13Q5J8X5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MS4A13Q5J8X5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MS4A13Q5J8X5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MS4A13Q5J8X5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MS4A13Q5J8X5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MS4A13Q5J8X5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MS4A13Q5J8X5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MS4A13Q5J8X5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MS4A13Q5J8X5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MS4A13Q5J8X5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms