Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH76

XKR4, XK-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 650 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR4Q5GH76 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
XKR4Q5GH76 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
XKR4Q5GH76 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
XKR4Q5GH76 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
XKR4Q5GH76 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
XKR4Q5GH76 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
XKR4Q5GH76 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
XKR4Q5GH76 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
XKR4Q5GH76 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
XKR4Q5GH76 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
XKR4Q5GH76 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
XKR4Q5GH76 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
XKR4Q5GH76 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
XKR4Q5GH76 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
XKR4Q5GH76 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
XKR4Q5GH76 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
XKR4Q5GH76 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
XKR4Q5GH76 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
XKR4Q5GH76 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
XKR4Q5GH76 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
XKR4Q5GH76 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
XKR4Q5GH76 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
XKR4Q5GH76 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
XKR4Q5GH76 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
XKR4Q5GH76 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
XKR4Q5GH76 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
XKR4Q5GH76 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
XKR4Q5GH76 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
XKR4Q5GH76 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
XKR4Q5GH76 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
XKR4Q5GH76 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
XKR4Q5GH76 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
XKR4Q5GH76 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
XKR4Q5GH76 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
XKR4Q5GH76 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
XKR4Q5GH76 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
XKR4Q5GH76 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
XKR4Q5GH76 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
XKR4Q5GH76 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
XKR4Q5GH76 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
XKR4Q5GH76 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
XKR4Q5GH76 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
XKR4Q5GH76 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
XKR4Q5GH76 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
XKR4Q5GH76 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
XKR4Q5GH76 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
XKR4Q5GH76 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
XKR4Q5GH76 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
XKR4Q5GH76 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
XKR4Q5GH76 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
XKR4Q5GH76 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
XKR4Q5GH76 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
XKR4Q5GH76 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
XKR4Q5GH76 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
XKR4Q5GH76 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
XKR4Q5GH76 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
XKR4Q5GH76 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
XKR4Q5GH76 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
XKR4Q5GH76 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
XKR4Q5GH76 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
XKR4Q5GH76 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
XKR4Q5GH76 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
XKR4Q5GH76 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
XKR4Q5GH76 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
XKR4Q5GH76 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
XKR4Q5GH76 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
XKR4Q5GH76 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
XKR4Q5GH76 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
XKR4Q5GH76 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
XKR4Q5GH76 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
XKR4Q5GH76 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
XKR4Q5GH76 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
XKR4Q5GH76 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
XKR4Q5GH76 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
XKR4Q5GH76 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
XKR4Q5GH76 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
XKR4Q5GH76 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
XKR4Q5GH76 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
XKR4Q5GH76 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
XKR4Q5GH76 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
XKR4Q5GH76 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
XKR4Q5GH76 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
XKR4Q5GH76 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
XKR4Q5GH76 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
XKR4Q5GH76 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
XKR4Q5GH76 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
XKR4Q5GH76 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
XKR4Q5GH76 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
XKR4Q5GH76 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
XKR4Q5GH76 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
XKR4Q5GH76 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
XKR4Q5GH76 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
XKR4Q5GH76 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
XKR4Q5GH76 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
XKR4Q5GH76 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
XKR4Q5GH76 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
XKR4Q5GH76 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
XKR4Q5GH76 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
XKR4Q5GH76 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
XKR4Q5GH76 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.4 ms