Protein–RNA interactions for Protein: Q58FF6

HSP90AB4P, Putative heat shock protein HSP 90-beta 4, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB4PQ58FF6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HSP90AB4PQ58FF6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HSP90AB4PQ58FF6 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HSP90AB4PQ58FF6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HSP90AB4PQ58FF6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HSP90AB4PQ58FF6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HSP90AB4PQ58FF6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HSP90AB4PQ58FF6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HSP90AB4PQ58FF6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HSP90AB4PQ58FF6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
HSP90AB4PQ58FF6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HSP90AB4PQ58FF6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HSP90AB4PQ58FF6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HSP90AB4PQ58FF6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HSP90AB4PQ58FF6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HSP90AB4PQ58FF6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HSP90AB4PQ58FF6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HSP90AB4PQ58FF6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HSP90AB4PQ58FF6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HSP90AB4PQ58FF6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HSP90AB4PQ58FF6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HSP90AB4PQ58FF6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HSP90AB4PQ58FF6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HSP90AB4PQ58FF6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HSP90AB4PQ58FF6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HSP90AB4PQ58FF6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HSP90AB4PQ58FF6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HSP90AB4PQ58FF6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HSP90AB4PQ58FF6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HSP90AB4PQ58FF6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HSP90AB4PQ58FF6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HSP90AB4PQ58FF6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HSP90AB4PQ58FF6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HSP90AB4PQ58FF6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HSP90AB4PQ58FF6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HSP90AB4PQ58FF6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HSP90AB4PQ58FF6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HSP90AB4PQ58FF6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HSP90AB4PQ58FF6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HSP90AB4PQ58FF6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HSP90AB4PQ58FF6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HSP90AB4PQ58FF6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HSP90AB4PQ58FF6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HSP90AB4PQ58FF6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HSP90AB4PQ58FF6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HSP90AB4PQ58FF6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HSP90AB4PQ58FF6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HSP90AB4PQ58FF6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HSP90AB4PQ58FF6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HSP90AB4PQ58FF6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HSP90AB4PQ58FF6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HSP90AB4PQ58FF6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HSP90AB4PQ58FF6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HSP90AB4PQ58FF6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HSP90AB4PQ58FF6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HSP90AB4PQ58FF6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HSP90AB4PQ58FF6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HSP90AB4PQ58FF6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HSP90AB4PQ58FF6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
HSP90AB4PQ58FF6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HSP90AB4PQ58FF6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HSP90AB4PQ58FF6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
HSP90AB4PQ58FF6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HSP90AB4PQ58FF6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HSP90AB4PQ58FF6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HSP90AB4PQ58FF6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
HSP90AB4PQ58FF6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HSP90AB4PQ58FF6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HSP90AB4PQ58FF6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HSP90AB4PQ58FF6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HSP90AB4PQ58FF6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HSP90AB4PQ58FF6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HSP90AB4PQ58FF6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HSP90AB4PQ58FF6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HSP90AB4PQ58FF6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HSP90AB4PQ58FF6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HSP90AB4PQ58FF6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HSP90AB4PQ58FF6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HSP90AB4PQ58FF6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HSP90AB4PQ58FF6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HSP90AB4PQ58FF6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HSP90AB4PQ58FF6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HSP90AB4PQ58FF6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HSP90AB4PQ58FF6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HSP90AB4PQ58FF6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HSP90AB4PQ58FF6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HSP90AB4PQ58FF6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HSP90AB4PQ58FF6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HSP90AB4PQ58FF6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
HSP90AB4PQ58FF6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HSP90AB4PQ58FF6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
HSP90AB4PQ58FF6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HSP90AB4PQ58FF6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HSP90AB4PQ58FF6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HSP90AB4PQ58FF6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HSP90AB4PQ58FF6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HSP90AB4PQ58FF6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HSP90AB4PQ58FF6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HSP90AB4PQ58FF6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HSP90AB4PQ58FF6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms