Protein–RNA interactions for Protein: Q58F21

BRDT, Bromodomain testis-specific protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRDTQ58F21 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRDTQ58F21 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BRDTQ58F21 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRDTQ58F21 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRDTQ58F21 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
BRDTQ58F21 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRDTQ58F21 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BRDTQ58F21 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRDTQ58F21 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRDTQ58F21 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRDTQ58F21 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRDTQ58F21 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRDTQ58F21 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BRDTQ58F21 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRDTQ58F21 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
BRDTQ58F21 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRDTQ58F21 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRDTQ58F21 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRDTQ58F21 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRDTQ58F21 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRDTQ58F21 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRDTQ58F21 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRDTQ58F21 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BRDTQ58F21 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRDTQ58F21 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRDTQ58F21 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRDTQ58F21 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRDTQ58F21 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRDTQ58F21 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRDTQ58F21 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
BRDTQ58F21 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRDTQ58F21 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRDTQ58F21 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRDTQ58F21 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRDTQ58F21 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BRDTQ58F21 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
BRDTQ58F21 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRDTQ58F21 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRDTQ58F21 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
BRDTQ58F21 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
BRDTQ58F21 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BRDTQ58F21 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRDTQ58F21 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRDTQ58F21 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRDTQ58F21 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRDTQ58F21 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRDTQ58F21 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
BRDTQ58F21 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRDTQ58F21 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRDTQ58F21 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRDTQ58F21 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BRDTQ58F21 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRDTQ58F21 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRDTQ58F21 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRDTQ58F21 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRDTQ58F21 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRDTQ58F21 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
BRDTQ58F21 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
BRDTQ58F21 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRDTQ58F21 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRDTQ58F21 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRDTQ58F21 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRDTQ58F21 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRDTQ58F21 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRDTQ58F21 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRDTQ58F21 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
BRDTQ58F21 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRDTQ58F21 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRDTQ58F21 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRDTQ58F21 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRDTQ58F21 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRDTQ58F21 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRDTQ58F21 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
BRDTQ58F21 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRDTQ58F21 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
BRDTQ58F21 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRDTQ58F21 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRDTQ58F21 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRDTQ58F21 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRDTQ58F21 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRDTQ58F21 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRDTQ58F21 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRDTQ58F21 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRDTQ58F21 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
BRDTQ58F21 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRDTQ58F21 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRDTQ58F21 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRDTQ58F21 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRDTQ58F21 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRDTQ58F21 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
BRDTQ58F21 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRDTQ58F21 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRDTQ58F21 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRDTQ58F21 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRDTQ58F21 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
BRDTQ58F21 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
BRDTQ58F21 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRDTQ58F21 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRDTQ58F21 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRDTQ58F21 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms