Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
KHDC3LQ587J8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
KHDC3LQ587J8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KHDC3LQ587J8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KHDC3LQ587J8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KHDC3LQ587J8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KHDC3LQ587J8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KHDC3LQ587J8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KHDC3LQ587J8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KHDC3LQ587J8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KHDC3LQ587J8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KHDC3LQ587J8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KHDC3LQ587J8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KHDC3LQ587J8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KHDC3LQ587J8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KHDC3LQ587J8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KHDC3LQ587J8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KHDC3LQ587J8 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KHDC3LQ587J8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KHDC3LQ587J8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KHDC3LQ587J8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KHDC3LQ587J8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KHDC3LQ587J8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KHDC3LQ587J8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KHDC3LQ587J8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KHDC3LQ587J8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KHDC3LQ587J8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KHDC3LQ587J8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KHDC3LQ587J8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KHDC3LQ587J8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KHDC3LQ587J8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KHDC3LQ587J8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KHDC3LQ587J8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KHDC3LQ587J8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KHDC3LQ587J8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KHDC3LQ587J8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KHDC3LQ587J8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KHDC3LQ587J8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KHDC3LQ587J8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KHDC3LQ587J8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KHDC3LQ587J8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KHDC3LQ587J8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KHDC3LQ587J8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KHDC3LQ587J8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KHDC3LQ587J8 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KHDC3LQ587J8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KHDC3LQ587J8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KHDC3LQ587J8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KHDC3LQ587J8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KHDC3LQ587J8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KHDC3LQ587J8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KHDC3LQ587J8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KHDC3LQ587J8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KHDC3LQ587J8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KHDC3LQ587J8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KHDC3LQ587J8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KHDC3LQ587J8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KHDC3LQ587J8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KHDC3LQ587J8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KHDC3LQ587J8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KHDC3LQ587J8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms