Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL22Q53GT1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL22Q53GT1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL22Q53GT1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL22Q53GT1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL22Q53GT1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL22Q53GT1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL22Q53GT1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL22Q53GT1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL22Q53GT1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL22Q53GT1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
KLHL22Q53GT1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL22Q53GT1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL22Q53GT1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL22Q53GT1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL22Q53GT1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL22Q53GT1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL22Q53GT1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL22Q53GT1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL22Q53GT1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL22Q53GT1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL22Q53GT1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL22Q53GT1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
KLHL22Q53GT1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
KLHL22Q53GT1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHL22Q53GT1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHL22Q53GT1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHL22Q53GT1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHL22Q53GT1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHL22Q53GT1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHL22Q53GT1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHL22Q53GT1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
KLHL22Q53GT1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL22Q53GT1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL22Q53GT1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL22Q53GT1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL22Q53GT1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL22Q53GT1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
KLHL22Q53GT1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL22Q53GT1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL22Q53GT1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL22Q53GT1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL22Q53GT1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL22Q53GT1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL22Q53GT1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL22Q53GT1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL22Q53GT1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL22Q53GT1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL22Q53GT1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL22Q53GT1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KLHL22Q53GT1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL22Q53GT1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL22Q53GT1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL22Q53GT1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL22Q53GT1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL22Q53GT1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL22Q53GT1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL22Q53GT1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL22Q53GT1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KLHL22Q53GT1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL22Q53GT1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL22Q53GT1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL22Q53GT1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL22Q53GT1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL22Q53GT1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL22Q53GT1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL22Q53GT1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL22Q53GT1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL22Q53GT1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL22Q53GT1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KLHL22Q53GT1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL22Q53GT1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL22Q53GT1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL22Q53GT1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL22Q53GT1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL22Q53GT1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL22Q53GT1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL22Q53GT1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL22Q53GT1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL22Q53GT1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL22Q53GT1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL22Q53GT1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL22Q53GT1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL22Q53GT1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL22Q53GT1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL22Q53GT1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHL22Q53GT1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHL22Q53GT1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHL22Q53GT1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHL22Q53GT1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHL22Q53GT1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL22Q53GT1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL22Q53GT1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL22Q53GT1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL22Q53GT1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL22Q53GT1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL22Q53GT1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL22Q53GT1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL22Q53GT1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL22Q53GT1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms