Protein–RNA interactions for Protein: Q53GI3

ZNF394, Zinc finger protein 394, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF394Q53GI3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF394Q53GI3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF394Q53GI3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF394Q53GI3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF394Q53GI3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF394Q53GI3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF394Q53GI3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF394Q53GI3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF394Q53GI3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF394Q53GI3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF394Q53GI3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF394Q53GI3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF394Q53GI3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF394Q53GI3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF394Q53GI3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZNF394Q53GI3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF394Q53GI3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF394Q53GI3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF394Q53GI3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF394Q53GI3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF394Q53GI3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF394Q53GI3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF394Q53GI3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF394Q53GI3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF394Q53GI3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF394Q53GI3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF394Q53GI3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF394Q53GI3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF394Q53GI3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF394Q53GI3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF394Q53GI3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF394Q53GI3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF394Q53GI3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF394Q53GI3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF394Q53GI3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF394Q53GI3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF394Q53GI3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF394Q53GI3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF394Q53GI3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF394Q53GI3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF394Q53GI3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF394Q53GI3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF394Q53GI3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF394Q53GI3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF394Q53GI3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF394Q53GI3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF394Q53GI3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF394Q53GI3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF394Q53GI3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF394Q53GI3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF394Q53GI3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF394Q53GI3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF394Q53GI3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF394Q53GI3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF394Q53GI3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF394Q53GI3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF394Q53GI3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF394Q53GI3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF394Q53GI3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF394Q53GI3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF394Q53GI3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF394Q53GI3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF394Q53GI3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF394Q53GI3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF394Q53GI3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF394Q53GI3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF394Q53GI3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF394Q53GI3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF394Q53GI3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF394Q53GI3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF394Q53GI3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF394Q53GI3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF394Q53GI3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF394Q53GI3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF394Q53GI3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF394Q53GI3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF394Q53GI3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF394Q53GI3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF394Q53GI3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF394Q53GI3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF394Q53GI3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF394Q53GI3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF394Q53GI3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF394Q53GI3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF394Q53GI3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF394Q53GI3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF394Q53GI3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF394Q53GI3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF394Q53GI3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF394Q53GI3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF394Q53GI3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF394Q53GI3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF394Q53GI3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF394Q53GI3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF394Q53GI3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF394Q53GI3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF394Q53GI3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF394Q53GI3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF394Q53GI3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF394Q53GI3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms