Protein–RNA interactions for Protein: Q4VC31

CCDC58, Coiled-coil domain-containing protein 58, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC58Q4VC31 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC58Q4VC31 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC58Q4VC31 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC58Q4VC31 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCDC58Q4VC31 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC58Q4VC31 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC58Q4VC31 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC58Q4VC31 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC58Q4VC31 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC58Q4VC31 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC58Q4VC31 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC58Q4VC31 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC58Q4VC31 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC58Q4VC31 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC58Q4VC31 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC58Q4VC31 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCDC58Q4VC31 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC58Q4VC31 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC58Q4VC31 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC58Q4VC31 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC58Q4VC31 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC58Q4VC31 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC58Q4VC31 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC58Q4VC31 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC58Q4VC31 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC58Q4VC31 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC58Q4VC31 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC58Q4VC31 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC58Q4VC31 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC58Q4VC31 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC58Q4VC31 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCDC58Q4VC31 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC58Q4VC31 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC58Q4VC31 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC58Q4VC31 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC58Q4VC31 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC58Q4VC31 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC58Q4VC31 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC58Q4VC31 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC58Q4VC31 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC58Q4VC31 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC58Q4VC31 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC58Q4VC31 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC58Q4VC31 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC58Q4VC31 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC58Q4VC31 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC58Q4VC31 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC58Q4VC31 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC58Q4VC31 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC58Q4VC31 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC58Q4VC31 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC58Q4VC31 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC58Q4VC31 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC58Q4VC31 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC58Q4VC31 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC58Q4VC31 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC58Q4VC31 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC58Q4VC31 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC58Q4VC31 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC58Q4VC31 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC58Q4VC31 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC58Q4VC31 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC58Q4VC31 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC58Q4VC31 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC58Q4VC31 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC58Q4VC31 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC58Q4VC31 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC58Q4VC31 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC58Q4VC31 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC58Q4VC31 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC58Q4VC31 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC58Q4VC31 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC58Q4VC31 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC58Q4VC31 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC58Q4VC31 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC58Q4VC31 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC58Q4VC31 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC58Q4VC31 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC58Q4VC31 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC58Q4VC31 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC58Q4VC31 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC58Q4VC31 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC58Q4VC31 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC58Q4VC31 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC58Q4VC31 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC58Q4VC31 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC58Q4VC31 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC58Q4VC31 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC58Q4VC31 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC58Q4VC31 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC58Q4VC31 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC58Q4VC31 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC58Q4VC31 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC58Q4VC31 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC58Q4VC31 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC58Q4VC31 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC58Q4VC31 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC58Q4VC31 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC58Q4VC31 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC58Q4VC31 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms