Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCQ8

TIMM50, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM50, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM50Q3ZCQ8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TIMM50Q3ZCQ8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TIMM50Q3ZCQ8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TIMM50Q3ZCQ8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TIMM50Q3ZCQ8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TIMM50Q3ZCQ8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TIMM50Q3ZCQ8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TIMM50Q3ZCQ8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TIMM50Q3ZCQ8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TIMM50Q3ZCQ8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TIMM50Q3ZCQ8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TIMM50Q3ZCQ8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TIMM50Q3ZCQ8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TIMM50Q3ZCQ8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TIMM50Q3ZCQ8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TIMM50Q3ZCQ8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TIMM50Q3ZCQ8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TIMM50Q3ZCQ8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TIMM50Q3ZCQ8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TIMM50Q3ZCQ8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TIMM50Q3ZCQ8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TIMM50Q3ZCQ8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TIMM50Q3ZCQ8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TIMM50Q3ZCQ8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TIMM50Q3ZCQ8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TIMM50Q3ZCQ8 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TIMM50Q3ZCQ8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TIMM50Q3ZCQ8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TIMM50Q3ZCQ8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TIMM50Q3ZCQ8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TIMM50Q3ZCQ8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TIMM50Q3ZCQ8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TIMM50Q3ZCQ8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TIMM50Q3ZCQ8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TIMM50Q3ZCQ8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TIMM50Q3ZCQ8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TIMM50Q3ZCQ8 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TIMM50Q3ZCQ8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIMM50Q3ZCQ8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIMM50Q3ZCQ8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIMM50Q3ZCQ8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIMM50Q3ZCQ8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIMM50Q3ZCQ8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIMM50Q3ZCQ8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIMM50Q3ZCQ8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIMM50Q3ZCQ8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIMM50Q3ZCQ8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIMM50Q3ZCQ8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIMM50Q3ZCQ8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIMM50Q3ZCQ8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIMM50Q3ZCQ8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIMM50Q3ZCQ8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TIMM50Q3ZCQ8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TIMM50Q3ZCQ8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TIMM50Q3ZCQ8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TIMM50Q3ZCQ8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TIMM50Q3ZCQ8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TIMM50Q3ZCQ8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TIMM50Q3ZCQ8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TIMM50Q3ZCQ8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TIMM50Q3ZCQ8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TIMM50Q3ZCQ8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TIMM50Q3ZCQ8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TIMM50Q3ZCQ8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TIMM50Q3ZCQ8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TIMM50Q3ZCQ8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TIMM50Q3ZCQ8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TIMM50Q3ZCQ8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TIMM50Q3ZCQ8 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TIMM50Q3ZCQ8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TIMM50Q3ZCQ8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TIMM50Q3ZCQ8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TIMM50Q3ZCQ8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TIMM50Q3ZCQ8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TIMM50Q3ZCQ8 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TIMM50Q3ZCQ8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TIMM50Q3ZCQ8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TIMM50Q3ZCQ8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TIMM50Q3ZCQ8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TIMM50Q3ZCQ8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TIMM50Q3ZCQ8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TIMM50Q3ZCQ8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TIMM50Q3ZCQ8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TIMM50Q3ZCQ8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TIMM50Q3ZCQ8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMM50Q3ZCQ8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMM50Q3ZCQ8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMM50Q3ZCQ8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMM50Q3ZCQ8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMM50Q3ZCQ8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMM50Q3ZCQ8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMM50Q3ZCQ8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMM50Q3ZCQ8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMM50Q3ZCQ8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TIMM50Q3ZCQ8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMM50Q3ZCQ8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMM50Q3ZCQ8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMM50Q3ZCQ8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMM50Q3ZCQ8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TIMM50Q3ZCQ8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms